Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHP6

Lrrn2, Leucine rich repeat protein 2, neuronal, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn2Q6PHP6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrn2Q6PHP6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrn2Q6PHP6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrn2Q6PHP6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrn2Q6PHP6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrn2Q6PHP6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrn2Q6PHP6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrn2Q6PHP6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrn2Q6PHP6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrn2Q6PHP6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrn2Q6PHP6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrn2Q6PHP6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrn2Q6PHP6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrrn2Q6PHP6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrrn2Q6PHP6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrrn2Q6PHP6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrrn2Q6PHP6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrrn2Q6PHP6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrrn2Q6PHP6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrrn2Q6PHP6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrrn2Q6PHP6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrrn2Q6PHP6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrn2Q6PHP6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrn2Q6PHP6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrn2Q6PHP6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrn2Q6PHP6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrn2Q6PHP6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrn2Q6PHP6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrn2Q6PHP6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrn2Q6PHP6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrn2Q6PHP6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrn2Q6PHP6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrrn2Q6PHP6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrrn2Q6PHP6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrrn2Q6PHP6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrrn2Q6PHP6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrrn2Q6PHP6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrrn2Q6PHP6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrrn2Q6PHP6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrrn2Q6PHP6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrrn2Q6PHP6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrrn2Q6PHP6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lrrn2Q6PHP6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lrrn2Q6PHP6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrrn2Q6PHP6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrrn2Q6PHP6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrrn2Q6PHP6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrrn2Q6PHP6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrn2Q6PHP6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrn2Q6PHP6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrn2Q6PHP6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrn2Q6PHP6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrn2Q6PHP6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrn2Q6PHP6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrn2Q6PHP6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrn2Q6PHP6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrn2Q6PHP6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrn2Q6PHP6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrn2Q6PHP6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrn2Q6PHP6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrn2Q6PHP6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrn2Q6PHP6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrn2Q6PHP6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrn2Q6PHP6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrn2Q6PHP6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrn2Q6PHP6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrn2Q6PHP6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrn2Q6PHP6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrn2Q6PHP6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrn2Q6PHP6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrn2Q6PHP6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrn2Q6PHP6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrn2Q6PHP6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrn2Q6PHP6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrn2Q6PHP6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrn2Q6PHP6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrn2Q6PHP6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrn2Q6PHP6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrn2Q6PHP6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrn2Q6PHP6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrn2Q6PHP6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrn2Q6PHP6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrn2Q6PHP6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrn2Q6PHP6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrn2Q6PHP6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrn2Q6PHP6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrn2Q6PHP6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrn2Q6PHP6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrn2Q6PHP6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrn2Q6PHP6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrn2Q6PHP6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrn2Q6PHP6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrn2Q6PHP6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrn2Q6PHP6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrn2Q6PHP6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrn2Q6PHP6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrn2Q6PHP6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrn2Q6PHP6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrn2Q6PHP6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrrn2Q6PHP6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms