Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF3

Med16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med16Q6PGF3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Med16Q6PGF3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Med16Q6PGF3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Med16Q6PGF3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Med16Q6PGF3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Med16Q6PGF3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Med16Q6PGF3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Med16Q6PGF3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Med16Q6PGF3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Med16Q6PGF3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Med16Q6PGF3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Med16Q6PGF3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Med16Q6PGF3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Med16Q6PGF3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Med16Q6PGF3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Med16Q6PGF3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Med16Q6PGF3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Med16Q6PGF3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Med16Q6PGF3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Med16Q6PGF3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Med16Q6PGF3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Med16Q6PGF3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Med16Q6PGF3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Med16Q6PGF3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Med16Q6PGF3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Med16Q6PGF3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Med16Q6PGF3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Med16Q6PGF3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Med16Q6PGF3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Med16Q6PGF3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Med16Q6PGF3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Med16Q6PGF3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Med16Q6PGF3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Med16Q6PGF3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Med16Q6PGF3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Med16Q6PGF3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Med16Q6PGF3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Med16Q6PGF3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Med16Q6PGF3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Med16Q6PGF3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Med16Q6PGF3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Med16Q6PGF3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Med16Q6PGF3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Med16Q6PGF3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Med16Q6PGF3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Med16Q6PGF3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Med16Q6PGF3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Med16Q6PGF3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Med16Q6PGF3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Med16Q6PGF3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Med16Q6PGF3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Med16Q6PGF3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Med16Q6PGF3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Med16Q6PGF3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Med16Q6PGF3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Med16Q6PGF3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Med16Q6PGF3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Med16Q6PGF3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Med16Q6PGF3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Med16Q6PGF3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Med16Q6PGF3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Med16Q6PGF3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Med16Q6PGF3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Med16Q6PGF3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Med16Q6PGF3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Med16Q6PGF3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Med16Q6PGF3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Med16Q6PGF3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Med16Q6PGF3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Med16Q6PGF3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Med16Q6PGF3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Med16Q6PGF3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Med16Q6PGF3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Med16Q6PGF3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Med16Q6PGF3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Med16Q6PGF3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Med16Q6PGF3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Med16Q6PGF3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Med16Q6PGF3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Med16Q6PGF3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Med16Q6PGF3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Med16Q6PGF3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Med16Q6PGF3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Med16Q6PGF3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Med16Q6PGF3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Med16Q6PGF3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Med16Q6PGF3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Med16Q6PGF3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Med16Q6PGF3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Med16Q6PGF3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Med16Q6PGF3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Med16Q6PGF3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Med16Q6PGF3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Med16Q6PGF3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Med16Q6PGF3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Med16Q6PGF3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Med16Q6PGF3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Med16Q6PGF3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Med16Q6PGF3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Med16Q6PGF3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms