Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smchd1Q6P5D8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smchd1Q6P5D8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smchd1Q6P5D8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Smchd1Q6P5D8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smchd1Q6P5D8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smchd1Q6P5D8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smchd1Q6P5D8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smchd1Q6P5D8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smchd1Q6P5D8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smchd1Q6P5D8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smchd1Q6P5D8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smchd1Q6P5D8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smchd1Q6P5D8 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Smchd1Q6P5D8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smchd1Q6P5D8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smchd1Q6P5D8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smchd1Q6P5D8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smchd1Q6P5D8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smchd1Q6P5D8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smchd1Q6P5D8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smchd1Q6P5D8 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smchd1Q6P5D8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smchd1Q6P5D8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smchd1Q6P5D8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smchd1Q6P5D8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smchd1Q6P5D8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smchd1Q6P5D8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smchd1Q6P5D8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smchd1Q6P5D8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Smchd1Q6P5D8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smchd1Q6P5D8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smchd1Q6P5D8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Smchd1Q6P5D8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smchd1Q6P5D8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smchd1Q6P5D8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smchd1Q6P5D8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smchd1Q6P5D8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smchd1Q6P5D8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smchd1Q6P5D8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smchd1Q6P5D8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smchd1Q6P5D8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smchd1Q6P5D8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smchd1Q6P5D8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smchd1Q6P5D8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Smchd1Q6P5D8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smchd1Q6P5D8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smchd1Q6P5D8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smchd1Q6P5D8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smchd1Q6P5D8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Smchd1Q6P5D8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smchd1Q6P5D8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smchd1Q6P5D8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smchd1Q6P5D8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smchd1Q6P5D8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smchd1Q6P5D8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smchd1Q6P5D8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smchd1Q6P5D8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Smchd1Q6P5D8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smchd1Q6P5D8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smchd1Q6P5D8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smchd1Q6P5D8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smchd1Q6P5D8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smchd1Q6P5D8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smchd1Q6P5D8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smchd1Q6P5D8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smchd1Q6P5D8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smchd1Q6P5D8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smchd1Q6P5D8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smchd1Q6P5D8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smchd1Q6P5D8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smchd1Q6P5D8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smchd1Q6P5D8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smchd1Q6P5D8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smchd1Q6P5D8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smchd1Q6P5D8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smchd1Q6P5D8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smchd1Q6P5D8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Smchd1Q6P5D8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smchd1Q6P5D8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smchd1Q6P5D8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smchd1Q6P5D8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smchd1Q6P5D8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smchd1Q6P5D8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smchd1Q6P5D8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smchd1Q6P5D8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smchd1Q6P5D8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smchd1Q6P5D8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Smchd1Q6P5D8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smchd1Q6P5D8 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smchd1Q6P5D8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smchd1Q6P5D8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smchd1Q6P5D8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smchd1Q6P5D8 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smchd1Q6P5D8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smchd1Q6P5D8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smchd1Q6P5D8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smchd1Q6P5D8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smchd1Q6P5D8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smchd1Q6P5D8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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