Protein–RNA interactions for Protein: Q6K1E7

Ggnbp1, Gametogenetin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggnbp1Q6K1E7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ggnbp1Q6K1E7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ggnbp1Q6K1E7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ggnbp1Q6K1E7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ggnbp1Q6K1E7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ggnbp1Q6K1E7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ggnbp1Q6K1E7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ggnbp1Q6K1E7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ggnbp1Q6K1E7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ggnbp1Q6K1E7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ggnbp1Q6K1E7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ggnbp1Q6K1E7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ggnbp1Q6K1E7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ggnbp1Q6K1E7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ggnbp1Q6K1E7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ggnbp1Q6K1E7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ggnbp1Q6K1E7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ggnbp1Q6K1E7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ggnbp1Q6K1E7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ggnbp1Q6K1E7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ggnbp1Q6K1E7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ggnbp1Q6K1E7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ggnbp1Q6K1E7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ggnbp1Q6K1E7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ggnbp1Q6K1E7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ggnbp1Q6K1E7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ggnbp1Q6K1E7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ggnbp1Q6K1E7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ggnbp1Q6K1E7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ggnbp1Q6K1E7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ggnbp1Q6K1E7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ggnbp1Q6K1E7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ggnbp1Q6K1E7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ggnbp1Q6K1E7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ggnbp1Q6K1E7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ggnbp1Q6K1E7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ggnbp1Q6K1E7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ggnbp1Q6K1E7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ggnbp1Q6K1E7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ggnbp1Q6K1E7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ggnbp1Q6K1E7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ggnbp1Q6K1E7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ggnbp1Q6K1E7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ggnbp1Q6K1E7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ggnbp1Q6K1E7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ggnbp1Q6K1E7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ggnbp1Q6K1E7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ggnbp1Q6K1E7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ggnbp1Q6K1E7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ggnbp1Q6K1E7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ggnbp1Q6K1E7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ggnbp1Q6K1E7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ggnbp1Q6K1E7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ggnbp1Q6K1E7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ggnbp1Q6K1E7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ggnbp1Q6K1E7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ggnbp1Q6K1E7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ggnbp1Q6K1E7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ggnbp1Q6K1E7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ggnbp1Q6K1E7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ggnbp1Q6K1E7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ggnbp1Q6K1E7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ggnbp1Q6K1E7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ggnbp1Q6K1E7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ggnbp1Q6K1E7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ggnbp1Q6K1E7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ggnbp1Q6K1E7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ggnbp1Q6K1E7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ggnbp1Q6K1E7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ggnbp1Q6K1E7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ggnbp1Q6K1E7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ggnbp1Q6K1E7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ggnbp1Q6K1E7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ggnbp1Q6K1E7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ggnbp1Q6K1E7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ggnbp1Q6K1E7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ggnbp1Q6K1E7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ggnbp1Q6K1E7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ggnbp1Q6K1E7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ggnbp1Q6K1E7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ggnbp1Q6K1E7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ggnbp1Q6K1E7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ggnbp1Q6K1E7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ggnbp1Q6K1E7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ggnbp1Q6K1E7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ggnbp1Q6K1E7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ggnbp1Q6K1E7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ggnbp1Q6K1E7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ggnbp1Q6K1E7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ggnbp1Q6K1E7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ggnbp1Q6K1E7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ggnbp1Q6K1E7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ggnbp1Q6K1E7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ggnbp1Q6K1E7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ggnbp1Q6K1E7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ggnbp1Q6K1E7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ggnbp1Q6K1E7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ggnbp1Q6K1E7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ggnbp1Q6K1E7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ggnbp1Q6K1E7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 153.4 ms