Protein–RNA interactions for Protein: Q6J756

Capn11, Calpain-11, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn11Q6J756 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Capn11Q6J756 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Capn11Q6J756 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Capn11Q6J756 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Capn11Q6J756 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Capn11Q6J756 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Capn11Q6J756 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Capn11Q6J756 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Capn11Q6J756 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Capn11Q6J756 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Capn11Q6J756 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Capn11Q6J756 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Capn11Q6J756 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Capn11Q6J756 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Capn11Q6J756 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Capn11Q6J756 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Capn11Q6J756 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Capn11Q6J756 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Capn11Q6J756 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Capn11Q6J756 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Capn11Q6J756 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Capn11Q6J756 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Capn11Q6J756 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Capn11Q6J756 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Capn11Q6J756 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Capn11Q6J756 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Capn11Q6J756 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Capn11Q6J756 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Capn11Q6J756 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Capn11Q6J756 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Capn11Q6J756 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Capn11Q6J756 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Capn11Q6J756 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Capn11Q6J756 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Capn11Q6J756 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Capn11Q6J756 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Capn11Q6J756 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Capn11Q6J756 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Capn11Q6J756 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Capn11Q6J756 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Capn11Q6J756 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Capn11Q6J756 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Capn11Q6J756 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Capn11Q6J756 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Capn11Q6J756 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Capn11Q6J756 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Capn11Q6J756 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Capn11Q6J756 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Capn11Q6J756 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Capn11Q6J756 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Capn11Q6J756 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Capn11Q6J756 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Capn11Q6J756 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Capn11Q6J756 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Capn11Q6J756 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Capn11Q6J756 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Capn11Q6J756 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Capn11Q6J756 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Capn11Q6J756 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Capn11Q6J756 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Capn11Q6J756 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Capn11Q6J756 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Capn11Q6J756 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Capn11Q6J756 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Capn11Q6J756 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Capn11Q6J756 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Capn11Q6J756 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Capn11Q6J756 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Capn11Q6J756 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Capn11Q6J756 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Capn11Q6J756 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Capn11Q6J756 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Capn11Q6J756 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Capn11Q6J756 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Capn11Q6J756 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Capn11Q6J756 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Capn11Q6J756 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Capn11Q6J756 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Capn11Q6J756 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Capn11Q6J756 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Capn11Q6J756 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Capn11Q6J756 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Capn11Q6J756 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Capn11Q6J756 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Capn11Q6J756 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Capn11Q6J756 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Capn11Q6J756 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Capn11Q6J756 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Capn11Q6J756 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Capn11Q6J756 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Capn11Q6J756 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Capn11Q6J756 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Capn11Q6J756 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Capn11Q6J756 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Capn11Q6J756 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Capn11Q6J756 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Capn11Q6J756 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Capn11Q6J756 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Capn11Q6J756 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Capn11Q6J756 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms