Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atg9aQ68FE2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atg9aQ68FE2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atg9aQ68FE2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atg9aQ68FE2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atg9aQ68FE2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Atg9aQ68FE2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atg9aQ68FE2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atg9aQ68FE2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atg9aQ68FE2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atg9aQ68FE2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atg9aQ68FE2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atg9aQ68FE2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atg9aQ68FE2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atg9aQ68FE2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atg9aQ68FE2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atg9aQ68FE2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atg9aQ68FE2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Atg9aQ68FE2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atg9aQ68FE2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atg9aQ68FE2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Atg9aQ68FE2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atg9aQ68FE2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atg9aQ68FE2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atg9aQ68FE2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atg9aQ68FE2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atg9aQ68FE2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atg9aQ68FE2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atg9aQ68FE2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atg9aQ68FE2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atg9aQ68FE2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Atg9aQ68FE2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Atg9aQ68FE2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atg9aQ68FE2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atg9aQ68FE2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atg9aQ68FE2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atg9aQ68FE2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atg9aQ68FE2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atg9aQ68FE2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atg9aQ68FE2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atg9aQ68FE2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atg9aQ68FE2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atg9aQ68FE2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atg9aQ68FE2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Atg9aQ68FE2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Atg9aQ68FE2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atg9aQ68FE2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atg9aQ68FE2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atg9aQ68FE2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Atg9aQ68FE2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atg9aQ68FE2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atg9aQ68FE2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atg9aQ68FE2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atg9aQ68FE2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atg9aQ68FE2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atg9aQ68FE2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atg9aQ68FE2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atg9aQ68FE2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atg9aQ68FE2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atg9aQ68FE2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atg9aQ68FE2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atg9aQ68FE2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atg9aQ68FE2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atg9aQ68FE2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atg9aQ68FE2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atg9aQ68FE2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atg9aQ68FE2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Atg9aQ68FE2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atg9aQ68FE2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Atg9aQ68FE2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Atg9aQ68FE2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atg9aQ68FE2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atg9aQ68FE2 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atg9aQ68FE2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Atg9aQ68FE2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Atg9aQ68FE2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atg9aQ68FE2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atg9aQ68FE2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atg9aQ68FE2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Atg9aQ68FE2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atg9aQ68FE2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atg9aQ68FE2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atg9aQ68FE2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atg9aQ68FE2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atg9aQ68FE2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atg9aQ68FE2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atg9aQ68FE2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atg9aQ68FE2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atg9aQ68FE2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atg9aQ68FE2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Atg9aQ68FE2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atg9aQ68FE2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atg9aQ68FE2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atg9aQ68FE2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atg9aQ68FE2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atg9aQ68FE2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atg9aQ68FE2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Atg9aQ68FE2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atg9aQ68FE2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atg9aQ68FE2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
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