Protein–RNA interactions for Protein: Q63850

Nup62, Nuclear pore glycoprotein p62, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup62Q63850 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nup62Q63850 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nup62Q63850 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nup62Q63850 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nup62Q63850 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nup62Q63850 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nup62Q63850 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nup62Q63850 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nup62Q63850 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nup62Q63850 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nup62Q63850 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nup62Q63850 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nup62Q63850 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nup62Q63850 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nup62Q63850 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Nup62Q63850 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nup62Q63850 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nup62Q63850 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nup62Q63850 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup62Q63850 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup62Q63850 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup62Q63850 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup62Q63850 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup62Q63850 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup62Q63850 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup62Q63850 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup62Q63850 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup62Q63850 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup62Q63850 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup62Q63850 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup62Q63850 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup62Q63850 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup62Q63850 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup62Q63850 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup62Q63850 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup62Q63850 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup62Q63850 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup62Q63850 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup62Q63850 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup62Q63850 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup62Q63850 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup62Q63850 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup62Q63850 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup62Q63850 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup62Q63850 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup62Q63850 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup62Q63850 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup62Q63850 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup62Q63850 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup62Q63850 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup62Q63850 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup62Q63850 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup62Q63850 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup62Q63850 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup62Q63850 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup62Q63850 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup62Q63850 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup62Q63850 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup62Q63850 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup62Q63850 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup62Q63850 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup62Q63850 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup62Q63850 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup62Q63850 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup62Q63850 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup62Q63850 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup62Q63850 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup62Q63850 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup62Q63850 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup62Q63850 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nup62Q63850 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nup62Q63850 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nup62Q63850 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nup62Q63850 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nup62Q63850 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nup62Q63850 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nup62Q63850 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nup62Q63850 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nup62Q63850 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nup62Q63850 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nup62Q63850 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nup62Q63850 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nup62Q63850 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nup62Q63850 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nup62Q63850 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nup62Q63850 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nup62Q63850 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nup62Q63850 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nup62Q63850 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nup62Q63850 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nup62Q63850 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nup62Q63850 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nup62Q63850 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nup62Q63850 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nup62Q63850 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Nup62Q63850 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nup62Q63850 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nup62Q63850 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nup62Q63850 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nup62Q63850 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms