Protein–RNA interactions for Protein: Q60715

P4ha1, Prolyl 4-hydroxylase subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P4ha1Q60715 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
P4ha1Q60715 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
P4ha1Q60715 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
P4ha1Q60715 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
P4ha1Q60715 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
P4ha1Q60715 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
P4ha1Q60715 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
P4ha1Q60715 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
P4ha1Q60715 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
P4ha1Q60715 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
P4ha1Q60715 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
P4ha1Q60715 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
P4ha1Q60715 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
P4ha1Q60715 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
P4ha1Q60715 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
P4ha1Q60715 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
P4ha1Q60715 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
P4ha1Q60715 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
P4ha1Q60715 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
P4ha1Q60715 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
P4ha1Q60715 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
P4ha1Q60715 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
P4ha1Q60715 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
P4ha1Q60715 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
P4ha1Q60715 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
P4ha1Q60715 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
P4ha1Q60715 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
P4ha1Q60715 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
P4ha1Q60715 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
P4ha1Q60715 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
P4ha1Q60715 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
P4ha1Q60715 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
P4ha1Q60715 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22■■□□□ 1.11
P4ha1Q60715 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
P4ha1Q60715 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
P4ha1Q60715 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
P4ha1Q60715 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
P4ha1Q60715 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
P4ha1Q60715 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
P4ha1Q60715 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
P4ha1Q60715 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
P4ha1Q60715 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
P4ha1Q60715 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
P4ha1Q60715 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
P4ha1Q60715 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
P4ha1Q60715 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
P4ha1Q60715 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
P4ha1Q60715 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
P4ha1Q60715 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
P4ha1Q60715 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
P4ha1Q60715 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
P4ha1Q60715 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
P4ha1Q60715 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
P4ha1Q60715 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
P4ha1Q60715 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
P4ha1Q60715 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
P4ha1Q60715 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
P4ha1Q60715 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
P4ha1Q60715 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
P4ha1Q60715 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
P4ha1Q60715 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
P4ha1Q60715 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
P4ha1Q60715 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
P4ha1Q60715 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
P4ha1Q60715 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
P4ha1Q60715 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
P4ha1Q60715 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
P4ha1Q60715 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
P4ha1Q60715 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
P4ha1Q60715 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
P4ha1Q60715 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
P4ha1Q60715 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
P4ha1Q60715 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
P4ha1Q60715 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
P4ha1Q60715 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
P4ha1Q60715 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
P4ha1Q60715 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
P4ha1Q60715 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
P4ha1Q60715 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
P4ha1Q60715 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
P4ha1Q60715 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
P4ha1Q60715 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
P4ha1Q60715 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
P4ha1Q60715 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
P4ha1Q60715 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
P4ha1Q60715 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
P4ha1Q60715 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
P4ha1Q60715 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
P4ha1Q60715 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
P4ha1Q60715 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
P4ha1Q60715 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
P4ha1Q60715 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
P4ha1Q60715 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
P4ha1Q60715 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
P4ha1Q60715 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
P4ha1Q60715 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
P4ha1Q60715 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
P4ha1Q60715 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
P4ha1Q60715 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
P4ha1Q60715 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms