Protein–RNA interactions for Protein: Q5U452

Trp53rka, MCG14616, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53rkaQ5U452 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trp53rkaQ5U452 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trp53rkaQ5U452 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trp53rkaQ5U452 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trp53rkaQ5U452 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trp53rkaQ5U452 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trp53rkaQ5U452 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trp53rkaQ5U452 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trp53rkaQ5U452 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trp53rkaQ5U452 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trp53rkaQ5U452 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trp53rkaQ5U452 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trp53rkaQ5U452 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trp53rkaQ5U452 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trp53rkaQ5U452 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trp53rkaQ5U452 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trp53rkaQ5U452 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trp53rkaQ5U452 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trp53rkaQ5U452 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trp53rkaQ5U452 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trp53rkaQ5U452 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trp53rkaQ5U452 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trp53rkaQ5U452 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trp53rkaQ5U452 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trp53rkaQ5U452 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trp53rkaQ5U452 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trp53rkaQ5U452 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trp53rkaQ5U452 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trp53rkaQ5U452 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trp53rkaQ5U452 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trp53rkaQ5U452 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trp53rkaQ5U452 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trp53rkaQ5U452 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trp53rkaQ5U452 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trp53rkaQ5U452 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trp53rkaQ5U452 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trp53rkaQ5U452 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trp53rkaQ5U452 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trp53rkaQ5U452 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trp53rkaQ5U452 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trp53rkaQ5U452 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trp53rkaQ5U452 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trp53rkaQ5U452 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trp53rkaQ5U452 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trp53rkaQ5U452 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trp53rkaQ5U452 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trp53rkaQ5U452 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trp53rkaQ5U452 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trp53rkaQ5U452 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trp53rkaQ5U452 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trp53rkaQ5U452 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trp53rkaQ5U452 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trp53rkaQ5U452 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trp53rkaQ5U452 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trp53rkaQ5U452 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trp53rkaQ5U452 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trp53rkaQ5U452 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trp53rkaQ5U452 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trp53rkaQ5U452 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trp53rkaQ5U452 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trp53rkaQ5U452 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trp53rkaQ5U452 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trp53rkaQ5U452 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trp53rkaQ5U452 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trp53rkaQ5U452 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trp53rkaQ5U452 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trp53rkaQ5U452 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trp53rkaQ5U452 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trp53rkaQ5U452 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trp53rkaQ5U452 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trp53rkaQ5U452 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trp53rkaQ5U452 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trp53rkaQ5U452 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trp53rkaQ5U452 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trp53rkaQ5U452 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trp53rkaQ5U452 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trp53rkaQ5U452 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trp53rkaQ5U452 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trp53rkaQ5U452 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trp53rkaQ5U452 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trp53rkaQ5U452 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trp53rkaQ5U452 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trp53rkaQ5U452 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trp53rkaQ5U452 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trp53rkaQ5U452 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Trp53rkaQ5U452 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trp53rkaQ5U452 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trp53rkaQ5U452 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trp53rkaQ5U452 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trp53rkaQ5U452 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trp53rkaQ5U452 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trp53rkaQ5U452 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trp53rkaQ5U452 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trp53rkaQ5U452 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trp53rkaQ5U452 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trp53rkaQ5U452 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trp53rkaQ5U452 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trp53rkaQ5U452 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trp53rkaQ5U452 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trp53rkaQ5U452 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms