Protein–RNA interactions for Protein: Q5F204

Mdh1b, Putative malate dehydrogenase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdh1bQ5F204 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mdh1bQ5F204 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mdh1bQ5F204 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mdh1bQ5F204 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mdh1bQ5F204 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Mdh1bQ5F204 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mdh1bQ5F204 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mdh1bQ5F204 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mdh1bQ5F204 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mdh1bQ5F204 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mdh1bQ5F204 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mdh1bQ5F204 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mdh1bQ5F204 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mdh1bQ5F204 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mdh1bQ5F204 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mdh1bQ5F204 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mdh1bQ5F204 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mdh1bQ5F204 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mdh1bQ5F204 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mdh1bQ5F204 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mdh1bQ5F204 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mdh1bQ5F204 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mdh1bQ5F204 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mdh1bQ5F204 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mdh1bQ5F204 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mdh1bQ5F204 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mdh1bQ5F204 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mdh1bQ5F204 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mdh1bQ5F204 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mdh1bQ5F204 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mdh1bQ5F204 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mdh1bQ5F204 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Mdh1bQ5F204 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mdh1bQ5F204 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mdh1bQ5F204 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mdh1bQ5F204 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mdh1bQ5F204 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mdh1bQ5F204 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Mdh1bQ5F204 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mdh1bQ5F204 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mdh1bQ5F204 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mdh1bQ5F204 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mdh1bQ5F204 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mdh1bQ5F204 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mdh1bQ5F204 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mdh1bQ5F204 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mdh1bQ5F204 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mdh1bQ5F204 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mdh1bQ5F204 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mdh1bQ5F204 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mdh1bQ5F204 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Mdh1bQ5F204 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mdh1bQ5F204 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mdh1bQ5F204 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mdh1bQ5F204 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mdh1bQ5F204 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mdh1bQ5F204 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mdh1bQ5F204 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mdh1bQ5F204 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Mdh1bQ5F204 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mdh1bQ5F204 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mdh1bQ5F204 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mdh1bQ5F204 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mdh1bQ5F204 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mdh1bQ5F204 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mdh1bQ5F204 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mdh1bQ5F204 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mdh1bQ5F204 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mdh1bQ5F204 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Mdh1bQ5F204 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mdh1bQ5F204 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mdh1bQ5F204 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mdh1bQ5F204 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Mdh1bQ5F204 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mdh1bQ5F204 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mdh1bQ5F204 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mdh1bQ5F204 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mdh1bQ5F204 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mdh1bQ5F204 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Mdh1bQ5F204 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mdh1bQ5F204 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mdh1bQ5F204 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mdh1bQ5F204 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mdh1bQ5F204 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mdh1bQ5F204 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mdh1bQ5F204 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mdh1bQ5F204 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mdh1bQ5F204 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mdh1bQ5F204 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mdh1bQ5F204 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mdh1bQ5F204 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mdh1bQ5F204 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mdh1bQ5F204 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mdh1bQ5F204 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mdh1bQ5F204 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mdh1bQ5F204 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mdh1bQ5F204 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mdh1bQ5F204 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mdh1bQ5F204 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mdh1bQ5F204 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128.1 ms