Protein–RNA interactions for Protein: Q587J6

L1td1, LINE-1 type transposase domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1td1Q587J6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
L1td1Q587J6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
L1td1Q587J6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
L1td1Q587J6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
L1td1Q587J6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
L1td1Q587J6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
L1td1Q587J6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
L1td1Q587J6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
L1td1Q587J6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
L1td1Q587J6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
L1td1Q587J6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
L1td1Q587J6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
L1td1Q587J6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
L1td1Q587J6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
L1td1Q587J6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
L1td1Q587J6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
L1td1Q587J6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
L1td1Q587J6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
L1td1Q587J6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
L1td1Q587J6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
L1td1Q587J6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
L1td1Q587J6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
L1td1Q587J6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
L1td1Q587J6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
L1td1Q587J6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
L1td1Q587J6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
L1td1Q587J6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
L1td1Q587J6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
L1td1Q587J6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
L1td1Q587J6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
L1td1Q587J6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
L1td1Q587J6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
L1td1Q587J6 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
L1td1Q587J6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
L1td1Q587J6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
L1td1Q587J6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
L1td1Q587J6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
L1td1Q587J6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
L1td1Q587J6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
L1td1Q587J6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
L1td1Q587J6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
L1td1Q587J6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
L1td1Q587J6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
L1td1Q587J6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
L1td1Q587J6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
L1td1Q587J6 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
L1td1Q587J6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
L1td1Q587J6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
L1td1Q587J6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
L1td1Q587J6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
L1td1Q587J6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
L1td1Q587J6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
L1td1Q587J6 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
L1td1Q587J6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
L1td1Q587J6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
L1td1Q587J6 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
L1td1Q587J6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
L1td1Q587J6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
L1td1Q587J6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
L1td1Q587J6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
L1td1Q587J6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
L1td1Q587J6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
L1td1Q587J6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
L1td1Q587J6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
L1td1Q587J6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
L1td1Q587J6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
L1td1Q587J6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
L1td1Q587J6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
L1td1Q587J6 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
L1td1Q587J6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
L1td1Q587J6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
L1td1Q587J6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
L1td1Q587J6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
L1td1Q587J6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
L1td1Q587J6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
L1td1Q587J6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
L1td1Q587J6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
L1td1Q587J6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
L1td1Q587J6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
L1td1Q587J6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
L1td1Q587J6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
L1td1Q587J6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
L1td1Q587J6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
L1td1Q587J6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
L1td1Q587J6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
L1td1Q587J6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
L1td1Q587J6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
L1td1Q587J6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
L1td1Q587J6 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
L1td1Q587J6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
L1td1Q587J6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
L1td1Q587J6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
L1td1Q587J6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
L1td1Q587J6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
L1td1Q587J6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
L1td1Q587J6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
L1td1Q587J6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
L1td1Q587J6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
L1td1Q587J6 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
L1td1Q587J6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms