Protein–RNA interactions for Protein: Q4VBF2

R3hdm4, R3H domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3hdm4Q4VBF2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
R3hdm4Q4VBF2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
R3hdm4Q4VBF2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
R3hdm4Q4VBF2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
R3hdm4Q4VBF2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
R3hdm4Q4VBF2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
R3hdm4Q4VBF2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
R3hdm4Q4VBF2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
R3hdm4Q4VBF2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
R3hdm4Q4VBF2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
R3hdm4Q4VBF2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
R3hdm4Q4VBF2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
R3hdm4Q4VBF2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
R3hdm4Q4VBF2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
R3hdm4Q4VBF2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
R3hdm4Q4VBF2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
R3hdm4Q4VBF2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
R3hdm4Q4VBF2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
R3hdm4Q4VBF2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
R3hdm4Q4VBF2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
R3hdm4Q4VBF2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
R3hdm4Q4VBF2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
R3hdm4Q4VBF2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
R3hdm4Q4VBF2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
R3hdm4Q4VBF2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
R3hdm4Q4VBF2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
R3hdm4Q4VBF2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
R3hdm4Q4VBF2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
R3hdm4Q4VBF2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
R3hdm4Q4VBF2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
R3hdm4Q4VBF2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
R3hdm4Q4VBF2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
R3hdm4Q4VBF2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
R3hdm4Q4VBF2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
R3hdm4Q4VBF2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
R3hdm4Q4VBF2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
R3hdm4Q4VBF2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
R3hdm4Q4VBF2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
R3hdm4Q4VBF2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
R3hdm4Q4VBF2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
R3hdm4Q4VBF2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
R3hdm4Q4VBF2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
R3hdm4Q4VBF2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
R3hdm4Q4VBF2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
R3hdm4Q4VBF2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
R3hdm4Q4VBF2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
R3hdm4Q4VBF2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
R3hdm4Q4VBF2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
R3hdm4Q4VBF2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
R3hdm4Q4VBF2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
R3hdm4Q4VBF2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
R3hdm4Q4VBF2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
R3hdm4Q4VBF2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
R3hdm4Q4VBF2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
R3hdm4Q4VBF2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
R3hdm4Q4VBF2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
R3hdm4Q4VBF2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
R3hdm4Q4VBF2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
R3hdm4Q4VBF2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
R3hdm4Q4VBF2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
R3hdm4Q4VBF2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
R3hdm4Q4VBF2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
R3hdm4Q4VBF2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
R3hdm4Q4VBF2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
R3hdm4Q4VBF2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
R3hdm4Q4VBF2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
R3hdm4Q4VBF2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
R3hdm4Q4VBF2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
R3hdm4Q4VBF2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
R3hdm4Q4VBF2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
R3hdm4Q4VBF2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
R3hdm4Q4VBF2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
R3hdm4Q4VBF2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
R3hdm4Q4VBF2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
R3hdm4Q4VBF2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
R3hdm4Q4VBF2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
R3hdm4Q4VBF2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
R3hdm4Q4VBF2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
R3hdm4Q4VBF2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
R3hdm4Q4VBF2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
R3hdm4Q4VBF2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
R3hdm4Q4VBF2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
R3hdm4Q4VBF2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
R3hdm4Q4VBF2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
R3hdm4Q4VBF2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
R3hdm4Q4VBF2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
R3hdm4Q4VBF2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
R3hdm4Q4VBF2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
R3hdm4Q4VBF2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
R3hdm4Q4VBF2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
R3hdm4Q4VBF2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
R3hdm4Q4VBF2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
R3hdm4Q4VBF2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
R3hdm4Q4VBF2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
R3hdm4Q4VBF2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
R3hdm4Q4VBF2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
R3hdm4Q4VBF2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
R3hdm4Q4VBF2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
R3hdm4Q4VBF2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
R3hdm4Q4VBF2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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