Protein–RNA interactions for Protein: Q497Q6

Fam228b, Protein FAM228B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam228bQ497Q6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fam228bQ497Q6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fam228bQ497Q6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fam228bQ497Q6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fam228bQ497Q6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fam228bQ497Q6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fam228bQ497Q6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fam228bQ497Q6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fam228bQ497Q6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fam228bQ497Q6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fam228bQ497Q6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fam228bQ497Q6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fam228bQ497Q6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fam228bQ497Q6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fam228bQ497Q6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fam228bQ497Q6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fam228bQ497Q6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Fam228bQ497Q6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Fam228bQ497Q6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fam228bQ497Q6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fam228bQ497Q6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fam228bQ497Q6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fam228bQ497Q6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fam228bQ497Q6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fam228bQ497Q6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fam228bQ497Q6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Fam228bQ497Q6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fam228bQ497Q6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fam228bQ497Q6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fam228bQ497Q6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fam228bQ497Q6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fam228bQ497Q6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fam228bQ497Q6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fam228bQ497Q6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fam228bQ497Q6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fam228bQ497Q6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fam228bQ497Q6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fam228bQ497Q6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fam228bQ497Q6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Fam228bQ497Q6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fam228bQ497Q6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fam228bQ497Q6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fam228bQ497Q6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fam228bQ497Q6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fam228bQ497Q6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fam228bQ497Q6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fam228bQ497Q6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Fam228bQ497Q6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fam228bQ497Q6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fam228bQ497Q6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fam228bQ497Q6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fam228bQ497Q6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fam228bQ497Q6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fam228bQ497Q6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fam228bQ497Q6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fam228bQ497Q6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fam228bQ497Q6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fam228bQ497Q6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fam228bQ497Q6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fam228bQ497Q6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fam228bQ497Q6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Fam228bQ497Q6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Fam228bQ497Q6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Fam228bQ497Q6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Fam228bQ497Q6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Fam228bQ497Q6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fam228bQ497Q6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fam228bQ497Q6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fam228bQ497Q6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fam228bQ497Q6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fam228bQ497Q6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fam228bQ497Q6 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Fam228bQ497Q6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fam228bQ497Q6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fam228bQ497Q6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Fam228bQ497Q6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fam228bQ497Q6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fam228bQ497Q6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fam228bQ497Q6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fam228bQ497Q6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Fam228bQ497Q6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fam228bQ497Q6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fam228bQ497Q6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fam228bQ497Q6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fam228bQ497Q6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fam228bQ497Q6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fam228bQ497Q6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fam228bQ497Q6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fam228bQ497Q6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fam228bQ497Q6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fam228bQ497Q6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fam228bQ497Q6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fam228bQ497Q6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fam228bQ497Q6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fam228bQ497Q6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fam228bQ497Q6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fam228bQ497Q6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fam228bQ497Q6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fam228bQ497Q6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fam228bQ497Q6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms