Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0K5

4930567H17Rik, RIKEN cDNA 4930567H17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930567H17RikQ3V0K5 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
4930567H17RikQ3V0K5 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
4930567H17RikQ3V0K5 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
4930567H17RikQ3V0K5 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
4930567H17RikQ3V0K5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
4930567H17RikQ3V0K5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
4930567H17RikQ3V0K5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
4930567H17RikQ3V0K5 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
4930567H17RikQ3V0K5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
4930567H17RikQ3V0K5 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
4930567H17RikQ3V0K5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
4930567H17RikQ3V0K5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
4930567H17RikQ3V0K5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
4930567H17RikQ3V0K5 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
4930567H17RikQ3V0K5 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
4930567H17RikQ3V0K5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
4930567H17RikQ3V0K5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
4930567H17RikQ3V0K5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
4930567H17RikQ3V0K5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
4930567H17RikQ3V0K5 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
4930567H17RikQ3V0K5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
4930567H17RikQ3V0K5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
4930567H17RikQ3V0K5 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
4930567H17RikQ3V0K5 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
4930567H17RikQ3V0K5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
4930567H17RikQ3V0K5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
4930567H17RikQ3V0K5 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
4930567H17RikQ3V0K5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
4930567H17RikQ3V0K5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
4930567H17RikQ3V0K5 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
4930567H17RikQ3V0K5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
4930567H17RikQ3V0K5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
4930567H17RikQ3V0K5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
4930567H17RikQ3V0K5 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
4930567H17RikQ3V0K5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
4930567H17RikQ3V0K5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
4930567H17RikQ3V0K5 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
4930567H17RikQ3V0K5 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
4930567H17RikQ3V0K5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
4930567H17RikQ3V0K5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
4930567H17RikQ3V0K5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
4930567H17RikQ3V0K5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
4930567H17RikQ3V0K5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
4930567H17RikQ3V0K5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
4930567H17RikQ3V0K5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
4930567H17RikQ3V0K5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
4930567H17RikQ3V0K5 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
4930567H17RikQ3V0K5 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
4930567H17RikQ3V0K5 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
4930567H17RikQ3V0K5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
4930567H17RikQ3V0K5 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
4930567H17RikQ3V0K5 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
4930567H17RikQ3V0K5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
4930567H17RikQ3V0K5 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
4930567H17RikQ3V0K5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
4930567H17RikQ3V0K5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
4930567H17RikQ3V0K5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
4930567H17RikQ3V0K5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
4930567H17RikQ3V0K5 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
4930567H17RikQ3V0K5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
4930567H17RikQ3V0K5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
4930567H17RikQ3V0K5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
4930567H17RikQ3V0K5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
4930567H17RikQ3V0K5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
4930567H17RikQ3V0K5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
4930567H17RikQ3V0K5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
4930567H17RikQ3V0K5 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
4930567H17RikQ3V0K5 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
4930567H17RikQ3V0K5 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
4930567H17RikQ3V0K5 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
4930567H17RikQ3V0K5 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
4930567H17RikQ3V0K5 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
4930567H17RikQ3V0K5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
4930567H17RikQ3V0K5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
4930567H17RikQ3V0K5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
4930567H17RikQ3V0K5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
4930567H17RikQ3V0K5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
4930567H17RikQ3V0K5 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
4930567H17RikQ3V0K5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
4930567H17RikQ3V0K5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
4930567H17RikQ3V0K5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
4930567H17RikQ3V0K5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
4930567H17RikQ3V0K5 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
4930567H17RikQ3V0K5 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
4930567H17RikQ3V0K5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
4930567H17RikQ3V0K5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
4930567H17RikQ3V0K5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
4930567H17RikQ3V0K5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
4930567H17RikQ3V0K5 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
4930567H17RikQ3V0K5 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
4930567H17RikQ3V0K5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
4930567H17RikQ3V0K5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
4930567H17RikQ3V0K5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
4930567H17RikQ3V0K5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
4930567H17RikQ3V0K5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
4930567H17RikQ3V0K5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
4930567H17RikQ3V0K5 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
4930567H17RikQ3V0K5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
4930567H17RikQ3V0K5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
4930567H17RikQ3V0K5 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms