Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX49

C87499, Expressed sequence C87499, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C87499Q3UX49 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C87499Q3UX49 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C87499Q3UX49 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C87499Q3UX49 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
C87499Q3UX49 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C87499Q3UX49 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C87499Q3UX49 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C87499Q3UX49 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C87499Q3UX49 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C87499Q3UX49 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C87499Q3UX49 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
C87499Q3UX49 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C87499Q3UX49 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C87499Q3UX49 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C87499Q3UX49 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C87499Q3UX49 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C87499Q3UX49 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C87499Q3UX49 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C87499Q3UX49 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C87499Q3UX49 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C87499Q3UX49 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
C87499Q3UX49 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C87499Q3UX49 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C87499Q3UX49 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C87499Q3UX49 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C87499Q3UX49 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C87499Q3UX49 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C87499Q3UX49 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
C87499Q3UX49 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C87499Q3UX49 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
C87499Q3UX49 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C87499Q3UX49 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C87499Q3UX49 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C87499Q3UX49 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C87499Q3UX49 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C87499Q3UX49 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C87499Q3UX49 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C87499Q3UX49 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C87499Q3UX49 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C87499Q3UX49 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C87499Q3UX49 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C87499Q3UX49 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
C87499Q3UX49 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
C87499Q3UX49 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C87499Q3UX49 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C87499Q3UX49 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C87499Q3UX49 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C87499Q3UX49 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
C87499Q3UX49 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C87499Q3UX49 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C87499Q3UX49 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C87499Q3UX49 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C87499Q3UX49 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C87499Q3UX49 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C87499Q3UX49 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C87499Q3UX49 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C87499Q3UX49 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C87499Q3UX49 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C87499Q3UX49 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C87499Q3UX49 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C87499Q3UX49 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C87499Q3UX49 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C87499Q3UX49 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C87499Q3UX49 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C87499Q3UX49 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C87499Q3UX49 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
C87499Q3UX49 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C87499Q3UX49 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C87499Q3UX49 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C87499Q3UX49 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C87499Q3UX49 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C87499Q3UX49 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C87499Q3UX49 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C87499Q3UX49 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C87499Q3UX49 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C87499Q3UX49 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C87499Q3UX49 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C87499Q3UX49 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C87499Q3UX49 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C87499Q3UX49 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C87499Q3UX49 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C87499Q3UX49 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C87499Q3UX49 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C87499Q3UX49 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C87499Q3UX49 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C87499Q3UX49 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C87499Q3UX49 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C87499Q3UX49 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C87499Q3UX49 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
C87499Q3UX49 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C87499Q3UX49 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C87499Q3UX49 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C87499Q3UX49 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C87499Q3UX49 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C87499Q3UX49 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C87499Q3UX49 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C87499Q3UX49 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C87499Q3UX49 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C87499Q3UX49 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C87499Q3UX49 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.3 ms