Protein–RNA interactions for Protein: Q3USH5

Sfswap, Splicing factor, suppressor of white-apricot homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 945 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SfswapQ3USH5 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SfswapQ3USH5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SfswapQ3USH5 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SfswapQ3USH5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SfswapQ3USH5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SfswapQ3USH5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SfswapQ3USH5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SfswapQ3USH5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SfswapQ3USH5 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SfswapQ3USH5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SfswapQ3USH5 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SfswapQ3USH5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SfswapQ3USH5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SfswapQ3USH5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SfswapQ3USH5 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SfswapQ3USH5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SfswapQ3USH5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SfswapQ3USH5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SfswapQ3USH5 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SfswapQ3USH5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SfswapQ3USH5 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SfswapQ3USH5 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SfswapQ3USH5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SfswapQ3USH5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SfswapQ3USH5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SfswapQ3USH5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SfswapQ3USH5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SfswapQ3USH5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SfswapQ3USH5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SfswapQ3USH5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SfswapQ3USH5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SfswapQ3USH5 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SfswapQ3USH5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SfswapQ3USH5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SfswapQ3USH5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SfswapQ3USH5 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SfswapQ3USH5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SfswapQ3USH5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SfswapQ3USH5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SfswapQ3USH5 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SfswapQ3USH5 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SfswapQ3USH5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SfswapQ3USH5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SfswapQ3USH5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SfswapQ3USH5 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SfswapQ3USH5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SfswapQ3USH5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SfswapQ3USH5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SfswapQ3USH5 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SfswapQ3USH5 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SfswapQ3USH5 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SfswapQ3USH5 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SfswapQ3USH5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SfswapQ3USH5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SfswapQ3USH5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SfswapQ3USH5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SfswapQ3USH5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SfswapQ3USH5 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SfswapQ3USH5 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SfswapQ3USH5 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SfswapQ3USH5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SfswapQ3USH5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SfswapQ3USH5 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SfswapQ3USH5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SfswapQ3USH5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SfswapQ3USH5 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SfswapQ3USH5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SfswapQ3USH5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SfswapQ3USH5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SfswapQ3USH5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SfswapQ3USH5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SfswapQ3USH5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SfswapQ3USH5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SfswapQ3USH5 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SfswapQ3USH5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SfswapQ3USH5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SfswapQ3USH5 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SfswapQ3USH5 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SfswapQ3USH5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SfswapQ3USH5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SfswapQ3USH5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SfswapQ3USH5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SfswapQ3USH5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SfswapQ3USH5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SfswapQ3USH5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SfswapQ3USH5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SfswapQ3USH5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SfswapQ3USH5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SfswapQ3USH5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SfswapQ3USH5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SfswapQ3USH5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SfswapQ3USH5 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SfswapQ3USH5 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SfswapQ3USH5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SfswapQ3USH5 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SfswapQ3USH5 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SfswapQ3USH5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SfswapQ3USH5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SfswapQ3USH5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SfswapQ3USH5 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms