Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nkx6-3Q3UHX8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nkx6-3Q3UHX8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
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Nkx6-3Q3UHX8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nkx6-3Q3UHX8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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