Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL44

Nlrx1, NLR family member X1, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrx1Q3TL44 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nlrx1Q3TL44 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nlrx1Q3TL44 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nlrx1Q3TL44 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nlrx1Q3TL44 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nlrx1Q3TL44 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nlrx1Q3TL44 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nlrx1Q3TL44 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nlrx1Q3TL44 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nlrx1Q3TL44 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nlrx1Q3TL44 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nlrx1Q3TL44 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nlrx1Q3TL44 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nlrx1Q3TL44 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nlrx1Q3TL44 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nlrx1Q3TL44 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nlrx1Q3TL44 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nlrx1Q3TL44 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Nlrx1Q3TL44 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nlrx1Q3TL44 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nlrx1Q3TL44 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nlrx1Q3TL44 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nlrx1Q3TL44 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Nlrx1Q3TL44 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nlrx1Q3TL44 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nlrx1Q3TL44 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nlrx1Q3TL44 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Nlrx1Q3TL44 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nlrx1Q3TL44 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nlrx1Q3TL44 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nlrx1Q3TL44 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nlrx1Q3TL44 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nlrx1Q3TL44 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nlrx1Q3TL44 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Nlrx1Q3TL44 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nlrx1Q3TL44 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nlrx1Q3TL44 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nlrx1Q3TL44 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nlrx1Q3TL44 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Nlrx1Q3TL44 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nlrx1Q3TL44 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nlrx1Q3TL44 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nlrx1Q3TL44 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nlrx1Q3TL44 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nlrx1Q3TL44 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nlrx1Q3TL44 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nlrx1Q3TL44 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nlrx1Q3TL44 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nlrx1Q3TL44 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nlrx1Q3TL44 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nlrx1Q3TL44 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nlrx1Q3TL44 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nlrx1Q3TL44 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nlrx1Q3TL44 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nlrx1Q3TL44 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nlrx1Q3TL44 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nlrx1Q3TL44 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nlrx1Q3TL44 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nlrx1Q3TL44 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Nlrx1Q3TL44 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nlrx1Q3TL44 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nlrx1Q3TL44 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nlrx1Q3TL44 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nlrx1Q3TL44 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nlrx1Q3TL44 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nlrx1Q3TL44 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Nlrx1Q3TL44 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Nlrx1Q3TL44 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nlrx1Q3TL44 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nlrx1Q3TL44 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nlrx1Q3TL44 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nlrx1Q3TL44 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nlrx1Q3TL44 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nlrx1Q3TL44 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nlrx1Q3TL44 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nlrx1Q3TL44 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nlrx1Q3TL44 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nlrx1Q3TL44 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nlrx1Q3TL44 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nlrx1Q3TL44 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nlrx1Q3TL44 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nlrx1Q3TL44 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nlrx1Q3TL44 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nlrx1Q3TL44 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nlrx1Q3TL44 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nlrx1Q3TL44 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nlrx1Q3TL44 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nlrx1Q3TL44 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nlrx1Q3TL44 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nlrx1Q3TL44 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nlrx1Q3TL44 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nlrx1Q3TL44 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nlrx1Q3TL44 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nlrx1Q3TL44 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nlrx1Q3TL44 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nlrx1Q3TL44 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nlrx1Q3TL44 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Nlrx1Q3TL44 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nlrx1Q3TL44 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nlrx1Q3TL44 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms