Protein–RNA interactions for Protein: Q3THK3

Gtf2f1, General transcription factor IIF subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2f1Q3THK3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf2f1Q3THK3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf2f1Q3THK3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf2f1Q3THK3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtf2f1Q3THK3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtf2f1Q3THK3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtf2f1Q3THK3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtf2f1Q3THK3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtf2f1Q3THK3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gtf2f1Q3THK3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gtf2f1Q3THK3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gtf2f1Q3THK3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gtf2f1Q3THK3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gtf2f1Q3THK3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gtf2f1Q3THK3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gtf2f1Q3THK3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gtf2f1Q3THK3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf2f1Q3THK3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf2f1Q3THK3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf2f1Q3THK3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf2f1Q3THK3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf2f1Q3THK3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf2f1Q3THK3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf2f1Q3THK3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf2f1Q3THK3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf2f1Q3THK3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf2f1Q3THK3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf2f1Q3THK3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf2f1Q3THK3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtf2f1Q3THK3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtf2f1Q3THK3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtf2f1Q3THK3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtf2f1Q3THK3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtf2f1Q3THK3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtf2f1Q3THK3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtf2f1Q3THK3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtf2f1Q3THK3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtf2f1Q3THK3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtf2f1Q3THK3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtf2f1Q3THK3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtf2f1Q3THK3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtf2f1Q3THK3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtf2f1Q3THK3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gtf2f1Q3THK3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gtf2f1Q3THK3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gtf2f1Q3THK3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gtf2f1Q3THK3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gtf2f1Q3THK3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gtf2f1Q3THK3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gtf2f1Q3THK3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gtf2f1Q3THK3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gtf2f1Q3THK3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gtf2f1Q3THK3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gtf2f1Q3THK3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gtf2f1Q3THK3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gtf2f1Q3THK3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gtf2f1Q3THK3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gtf2f1Q3THK3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gtf2f1Q3THK3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Gtf2f1Q3THK3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gtf2f1Q3THK3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gtf2f1Q3THK3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtf2f1Q3THK3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtf2f1Q3THK3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtf2f1Q3THK3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtf2f1Q3THK3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtf2f1Q3THK3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtf2f1Q3THK3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtf2f1Q3THK3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtf2f1Q3THK3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtf2f1Q3THK3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtf2f1Q3THK3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gtf2f1Q3THK3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gtf2f1Q3THK3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Gtf2f1Q3THK3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gtf2f1Q3THK3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gtf2f1Q3THK3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gtf2f1Q3THK3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf2f1Q3THK3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf2f1Q3THK3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf2f1Q3THK3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf2f1Q3THK3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf2f1Q3THK3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf2f1Q3THK3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf2f1Q3THK3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf2f1Q3THK3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf2f1Q3THK3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gtf2f1Q3THK3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gtf2f1Q3THK3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gtf2f1Q3THK3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gtf2f1Q3THK3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gtf2f1Q3THK3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gtf2f1Q3THK3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gtf2f1Q3THK3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gtf2f1Q3THK3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gtf2f1Q3THK3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gtf2f1Q3THK3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gtf2f1Q3THK3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gtf2f1Q3THK3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtf2f1Q3THK3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.2 ms