Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ptchd1Q14B62 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ptchd1Q14B62 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ptchd1Q14B62 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ptchd1Q14B62 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ptchd1Q14B62 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ptchd1Q14B62 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ptchd1Q14B62 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ptchd1Q14B62 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ptchd1Q14B62 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ptchd1Q14B62 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ptchd1Q14B62 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ptchd1Q14B62 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ptchd1Q14B62 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ptchd1Q14B62 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ptchd1Q14B62 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ptchd1Q14B62 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ptchd1Q14B62 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ptchd1Q14B62 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ptchd1Q14B62 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ptchd1Q14B62 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ptchd1Q14B62 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ptchd1Q14B62 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ptchd1Q14B62 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ptchd1Q14B62 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ptchd1Q14B62 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ptchd1Q14B62 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ptchd1Q14B62 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ptchd1Q14B62 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ptchd1Q14B62 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ptchd1Q14B62 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ptchd1Q14B62 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ptchd1Q14B62 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ptchd1Q14B62 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ptchd1Q14B62 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ptchd1Q14B62 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ptchd1Q14B62 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ptchd1Q14B62 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ptchd1Q14B62 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ptchd1Q14B62 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ptchd1Q14B62 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ptchd1Q14B62 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ptchd1Q14B62 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ptchd1Q14B62 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ptchd1Q14B62 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ptchd1Q14B62 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ptchd1Q14B62 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ptchd1Q14B62 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ptchd1Q14B62 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ptchd1Q14B62 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ptchd1Q14B62 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ptchd1Q14B62 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ptchd1Q14B62 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ptchd1Q14B62 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ptchd1Q14B62 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ptchd1Q14B62 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ptchd1Q14B62 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ptchd1Q14B62 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ptchd1Q14B62 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ptchd1Q14B62 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ptchd1Q14B62 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ptchd1Q14B62 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ptchd1Q14B62 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ptchd1Q14B62 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ptchd1Q14B62 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ptchd1Q14B62 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ptchd1Q14B62 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ptchd1Q14B62 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ptchd1Q14B62 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ptchd1Q14B62 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ptchd1Q14B62 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ptchd1Q14B62 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ptchd1Q14B62 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ptchd1Q14B62 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ptchd1Q14B62 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ptchd1Q14B62 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ptchd1Q14B62 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ptchd1Q14B62 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ptchd1Q14B62 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ptchd1Q14B62 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ptchd1Q14B62 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ptchd1Q14B62 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ptchd1Q14B62 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ptchd1Q14B62 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ptchd1Q14B62 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ptchd1Q14B62 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ptchd1Q14B62 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ptchd1Q14B62 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ptchd1Q14B62 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ptchd1Q14B62 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ptchd1Q14B62 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ptchd1Q14B62 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ptchd1Q14B62 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ptchd1Q14B62 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ptchd1Q14B62 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ptchd1Q14B62 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ptchd1Q14B62 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ptchd1Q14B62 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ptchd1Q14B62 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ptchd1Q14B62 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms