Protein–RNA interactions for Protein: Q03137

Epha4, Ephrin type-A receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 986 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha4Q03137 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Epha4Q03137 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Epha4Q03137 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Epha4Q03137 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Epha4Q03137 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Epha4Q03137 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Epha4Q03137 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Epha4Q03137 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Epha4Q03137 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Epha4Q03137 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Epha4Q03137 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Epha4Q03137 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Epha4Q03137 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Epha4Q03137 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Epha4Q03137 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Epha4Q03137 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Epha4Q03137 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Epha4Q03137 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Epha4Q03137 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Epha4Q03137 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Epha4Q03137 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Epha4Q03137 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Epha4Q03137 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Epha4Q03137 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Epha4Q03137 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Epha4Q03137 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Epha4Q03137 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Epha4Q03137 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Epha4Q03137 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Epha4Q03137 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Epha4Q03137 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Epha4Q03137 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Epha4Q03137 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Epha4Q03137 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Epha4Q03137 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Epha4Q03137 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Epha4Q03137 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Epha4Q03137 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Epha4Q03137 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Epha4Q03137 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Epha4Q03137 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Epha4Q03137 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Epha4Q03137 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Epha4Q03137 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Epha4Q03137 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Epha4Q03137 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Epha4Q03137 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Epha4Q03137 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Epha4Q03137 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Epha4Q03137 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Epha4Q03137 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Epha4Q03137 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Epha4Q03137 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Epha4Q03137 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Epha4Q03137 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Epha4Q03137 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Epha4Q03137 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Epha4Q03137 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Epha4Q03137 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Epha4Q03137 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Epha4Q03137 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Epha4Q03137 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Epha4Q03137 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Epha4Q03137 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Epha4Q03137 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Epha4Q03137 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Epha4Q03137 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Epha4Q03137 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Epha4Q03137 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Epha4Q03137 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Epha4Q03137 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Epha4Q03137 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Epha4Q03137 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Epha4Q03137 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Epha4Q03137 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Epha4Q03137 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Epha4Q03137 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Epha4Q03137 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Epha4Q03137 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Epha4Q03137 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Epha4Q03137 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Epha4Q03137 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Epha4Q03137 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Epha4Q03137 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Epha4Q03137 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Epha4Q03137 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Epha4Q03137 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Epha4Q03137 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Epha4Q03137 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Epha4Q03137 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Epha4Q03137 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Epha4Q03137 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Epha4Q03137 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Epha4Q03137 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Epha4Q03137 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Epha4Q03137 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Epha4Q03137 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Epha4Q03137 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Epha4Q03137 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Epha4Q03137 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms