Protein–RNA interactions for Protein: Q00899

Yy1, Transcriptional repressor protein YY1, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yy1Q00899 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Yy1Q00899 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Yy1Q00899 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Yy1Q00899 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Yy1Q00899 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Yy1Q00899 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Yy1Q00899 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Yy1Q00899 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Yy1Q00899 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Yy1Q00899 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Yy1Q00899 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Yy1Q00899 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Yy1Q00899 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Yy1Q00899 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Yy1Q00899 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Yy1Q00899 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Yy1Q00899 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Yy1Q00899 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Yy1Q00899 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Yy1Q00899 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Yy1Q00899 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Yy1Q00899 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Yy1Q00899 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Yy1Q00899 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Yy1Q00899 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Yy1Q00899 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Yy1Q00899 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Yy1Q00899 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Yy1Q00899 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Yy1Q00899 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Yy1Q00899 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Yy1Q00899 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Yy1Q00899 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Yy1Q00899 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Yy1Q00899 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Yy1Q00899 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Yy1Q00899 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Yy1Q00899 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Yy1Q00899 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Yy1Q00899 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Yy1Q00899 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Yy1Q00899 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Yy1Q00899 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Yy1Q00899 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Yy1Q00899 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Yy1Q00899 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Yy1Q00899 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Yy1Q00899 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Yy1Q00899 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Yy1Q00899 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Yy1Q00899 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Yy1Q00899 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Yy1Q00899 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Yy1Q00899 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Yy1Q00899 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Yy1Q00899 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Yy1Q00899 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Yy1Q00899 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Yy1Q00899 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Yy1Q00899 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Yy1Q00899 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Yy1Q00899 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Yy1Q00899 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Yy1Q00899 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Yy1Q00899 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Yy1Q00899 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Yy1Q00899 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Yy1Q00899 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Yy1Q00899 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Yy1Q00899 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Yy1Q00899 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Yy1Q00899 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Yy1Q00899 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Yy1Q00899 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Yy1Q00899 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Yy1Q00899 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Yy1Q00899 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Yy1Q00899 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Yy1Q00899 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Yy1Q00899 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Yy1Q00899 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Yy1Q00899 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Yy1Q00899 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Yy1Q00899 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Yy1Q00899 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Yy1Q00899 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Yy1Q00899 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Yy1Q00899 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Yy1Q00899 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Yy1Q00899 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Yy1Q00899 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Yy1Q00899 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Yy1Q00899 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Yy1Q00899 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Yy1Q00899 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Yy1Q00899 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Yy1Q00899 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Yy1Q00899 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Yy1Q00899 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Yy1Q00899 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms