Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Apoa1Q00623 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Apoa1Q00623 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Apoa1Q00623 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Apoa1Q00623 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Apoa1Q00623 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Apoa1Q00623 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Apoa1Q00623 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Apoa1Q00623 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Apoa1Q00623 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Apoa1Q00623 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Apoa1Q00623 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Apoa1Q00623 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apoa1Q00623 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apoa1Q00623 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apoa1Q00623 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apoa1Q00623 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apoa1Q00623 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apoa1Q00623 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apoa1Q00623 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apoa1Q00623 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apoa1Q00623 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Apoa1Q00623 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apoa1Q00623 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apoa1Q00623 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apoa1Q00623 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apoa1Q00623 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apoa1Q00623 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apoa1Q00623 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apoa1Q00623 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apoa1Q00623 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apoa1Q00623 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apoa1Q00623 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apoa1Q00623 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apoa1Q00623 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apoa1Q00623 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apoa1Q00623 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Apoa1Q00623 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Apoa1Q00623 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Apoa1Q00623 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Apoa1Q00623 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Apoa1Q00623 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Apoa1Q00623 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Apoa1Q00623 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Apoa1Q00623 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Apoa1Q00623 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Apoa1Q00623 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Apoa1Q00623 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Apoa1Q00623 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Apoa1Q00623 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Apoa1Q00623 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Apoa1Q00623 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Apoa1Q00623 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Apoa1Q00623 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Apoa1Q00623 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Apoa1Q00623 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Apoa1Q00623 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Apoa1Q00623 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Apoa1Q00623 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Apoa1Q00623 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Apoa1Q00623 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Apoa1Q00623 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Apoa1Q00623 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Apoa1Q00623 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Apoa1Q00623 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Apoa1Q00623 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Apoa1Q00623 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Apoa1Q00623 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Apoa1Q00623 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Apoa1Q00623 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Apoa1Q00623 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Apoa1Q00623 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Apoa1Q00623 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Apoa1Q00623 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Apoa1Q00623 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Apoa1Q00623 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Apoa1Q00623 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Apoa1Q00623 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Apoa1Q00623 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Apoa1Q00623 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Apoa1Q00623 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Apoa1Q00623 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Apoa1Q00623 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Apoa1Q00623 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Apoa1Q00623 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Apoa1Q00623 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Apoa1Q00623 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Apoa1Q00623 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Apoa1Q00623 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Apoa1Q00623 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Apoa1Q00623 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Apoa1Q00623 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Apoa1Q00623 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Apoa1Q00623 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Apoa1Q00623 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Apoa1Q00623 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apoa1Q00623 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apoa1Q00623 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apoa1Q00623 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apoa1Q00623 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.3 ms