Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snap25P60879 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snap25P60879 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snap25P60879 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snap25P60879 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snap25P60879 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snap25P60879 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snap25P60879 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snap25P60879 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snap25P60879 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snap25P60879 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snap25P60879 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snap25P60879 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snap25P60879 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Snap25P60879 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snap25P60879 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Snap25P60879 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Snap25P60879 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Snap25P60879 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Snap25P60879 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snap25P60879 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snap25P60879 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snap25P60879 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snap25P60879 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snap25P60879 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snap25P60879 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snap25P60879 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snap25P60879 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snap25P60879 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snap25P60879 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snap25P60879 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snap25P60879 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snap25P60879 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snap25P60879 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snap25P60879 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snap25P60879 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snap25P60879 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snap25P60879 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snap25P60879 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snap25P60879 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Snap25P60879 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snap25P60879 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snap25P60879 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snap25P60879 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snap25P60879 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snap25P60879 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snap25P60879 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snap25P60879 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snap25P60879 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snap25P60879 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Snap25P60879 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snap25P60879 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snap25P60879 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snap25P60879 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Snap25P60879 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snap25P60879 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Snap25P60879 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snap25P60879 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snap25P60879 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snap25P60879 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snap25P60879 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snap25P60879 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snap25P60879 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Snap25P60879 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Snap25P60879 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Snap25P60879 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Snap25P60879 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Snap25P60879 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snap25P60879 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snap25P60879 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snap25P60879 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snap25P60879 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snap25P60879 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snap25P60879 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snap25P60879 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snap25P60879 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snap25P60879 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snap25P60879 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snap25P60879 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snap25P60879 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snap25P60879 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snap25P60879 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Snap25P60879 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Snap25P60879 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snap25P60879 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snap25P60879 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snap25P60879 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snap25P60879 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snap25P60879 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snap25P60879 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snap25P60879 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snap25P60879 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snap25P60879 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snap25P60879 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snap25P60879 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snap25P60879 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snap25P60879 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snap25P60879 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snap25P60879 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Snap25P60879 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms