Protein–RNA interactions for Protein: P53996

Cnbp, Cellular nucleic acid-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CnbpP53996 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CnbpP53996 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CnbpP53996 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CnbpP53996 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CnbpP53996 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CnbpP53996 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CnbpP53996 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CnbpP53996 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CnbpP53996 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CnbpP53996 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CnbpP53996 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CnbpP53996 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CnbpP53996 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CnbpP53996 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CnbpP53996 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CnbpP53996 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
CnbpP53996 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CnbpP53996 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CnbpP53996 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CnbpP53996 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CnbpP53996 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CnbpP53996 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CnbpP53996 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CnbpP53996 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CnbpP53996 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CnbpP53996 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CnbpP53996 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CnbpP53996 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CnbpP53996 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CnbpP53996 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CnbpP53996 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CnbpP53996 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CnbpP53996 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CnbpP53996 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CnbpP53996 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
CnbpP53996 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CnbpP53996 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
CnbpP53996 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CnbpP53996 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CnbpP53996 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CnbpP53996 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CnbpP53996 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CnbpP53996 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CnbpP53996 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CnbpP53996 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CnbpP53996 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CnbpP53996 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CnbpP53996 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CnbpP53996 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CnbpP53996 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CnbpP53996 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CnbpP53996 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CnbpP53996 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CnbpP53996 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CnbpP53996 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CnbpP53996 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CnbpP53996 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CnbpP53996 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CnbpP53996 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
CnbpP53996 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
CnbpP53996 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CnbpP53996 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CnbpP53996 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CnbpP53996 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CnbpP53996 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CnbpP53996 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CnbpP53996 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CnbpP53996 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CnbpP53996 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CnbpP53996 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CnbpP53996 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CnbpP53996 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CnbpP53996 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CnbpP53996 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CnbpP53996 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CnbpP53996 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CnbpP53996 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CnbpP53996 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CnbpP53996 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CnbpP53996 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CnbpP53996 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CnbpP53996 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CnbpP53996 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CnbpP53996 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CnbpP53996 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CnbpP53996 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CnbpP53996 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CnbpP53996 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CnbpP53996 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CnbpP53996 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CnbpP53996 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CnbpP53996 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CnbpP53996 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CnbpP53996 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CnbpP53996 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CnbpP53996 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CnbpP53996 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CnbpP53996 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CnbpP53996 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CnbpP53996 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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