Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Upp1P52624 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Upp1P52624 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Upp1P52624 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Upp1P52624 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Upp1P52624 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Upp1P52624 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Upp1P52624 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Upp1P52624 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Upp1P52624 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Upp1P52624 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Upp1P52624 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Upp1P52624 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Upp1P52624 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Upp1P52624 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Upp1P52624 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Upp1P52624 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Upp1P52624 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Upp1P52624 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Upp1P52624 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Upp1P52624 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Upp1P52624 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Upp1P52624 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Upp1P52624 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Upp1P52624 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Upp1P52624 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Upp1P52624 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Upp1P52624 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Upp1P52624 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Upp1P52624 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Upp1P52624 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Upp1P52624 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Upp1P52624 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Upp1P52624 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Upp1P52624 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Upp1P52624 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Upp1P52624 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Upp1P52624 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Upp1P52624 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Upp1P52624 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Upp1P52624 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Upp1P52624 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Upp1P52624 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Upp1P52624 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Upp1P52624 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Upp1P52624 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Upp1P52624 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Upp1P52624 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Upp1P52624 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Upp1P52624 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Upp1P52624 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Upp1P52624 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Upp1P52624 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Upp1P52624 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Upp1P52624 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Upp1P52624 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Upp1P52624 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Upp1P52624 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Upp1P52624 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Upp1P52624 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Upp1P52624 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Upp1P52624 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Upp1P52624 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Upp1P52624 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Upp1P52624 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Upp1P52624 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Upp1P52624 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Upp1P52624 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Upp1P52624 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Upp1P52624 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Upp1P52624 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Upp1P52624 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Upp1P52624 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Upp1P52624 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Upp1P52624 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Upp1P52624 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Upp1P52624 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Upp1P52624 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Upp1P52624 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Upp1P52624 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Upp1P52624 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Upp1P52624 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Upp1P52624 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Upp1P52624 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Upp1P52624 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Upp1P52624 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Upp1P52624 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Upp1P52624 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Upp1P52624 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Upp1P52624 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Upp1P52624 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Upp1P52624 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Upp1P52624 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Upp1P52624 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Upp1P52624 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Upp1P52624 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Upp1P52624 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Upp1P52624 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Upp1P52624 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Upp1P52624 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms