Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nedd4P46935 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nedd4P46935 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Nedd4P46935 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Nedd4P46935 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nedd4P46935 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nedd4P46935 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nedd4P46935 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nedd4P46935 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nedd4P46935 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nedd4P46935 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nedd4P46935 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nedd4P46935 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nedd4P46935 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nedd4P46935 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nedd4P46935 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Nedd4P46935 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nedd4P46935 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Nedd4P46935 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nedd4P46935 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Nedd4P46935 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nedd4P46935 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nedd4P46935 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nedd4P46935 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nedd4P46935 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nedd4P46935 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nedd4P46935 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nedd4P46935 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nedd4P46935 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nedd4P46935 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nedd4P46935 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nedd4P46935 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nedd4P46935 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nedd4P46935 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nedd4P46935 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nedd4P46935 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nedd4P46935 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nedd4P46935 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nedd4P46935 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nedd4P46935 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nedd4P46935 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nedd4P46935 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nedd4P46935 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nedd4P46935 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nedd4P46935 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Nedd4P46935 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Nedd4P46935 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Nedd4P46935 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Nedd4P46935 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Nedd4P46935 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nedd4P46935 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nedd4P46935 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nedd4P46935 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nedd4P46935 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nedd4P46935 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nedd4P46935 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nedd4P46935 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nedd4P46935 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nedd4P46935 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nedd4P46935 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nedd4P46935 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Nedd4P46935 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nedd4P46935 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Nedd4P46935 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nedd4P46935 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nedd4P46935 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nedd4P46935 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nedd4P46935 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Nedd4P46935 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nedd4P46935 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nedd4P46935 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nedd4P46935 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nedd4P46935 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nedd4P46935 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Nedd4P46935 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nedd4P46935 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nedd4P46935 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nedd4P46935 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nedd4P46935 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nedd4P46935 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nedd4P46935 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nedd4P46935 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nedd4P46935 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nedd4P46935 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nedd4P46935 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nedd4P46935 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Nedd4P46935 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nedd4P46935 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nedd4P46935 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nedd4P46935 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nedd4P46935 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nedd4P46935 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nedd4P46935 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nedd4P46935 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nedd4P46935 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nedd4P46935 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nedd4P46935 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nedd4P46935 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nedd4P46935 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nedd4P46935 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 201.7 ms