Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdkn1bP46414 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdkn1bP46414 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdkn1bP46414 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdkn1bP46414 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdkn1bP46414 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdkn1bP46414 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdkn1bP46414 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdkn1bP46414 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdkn1bP46414 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdkn1bP46414 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdkn1bP46414 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdkn1bP46414 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdkn1bP46414 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdkn1bP46414 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdkn1bP46414 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdkn1bP46414 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdkn1bP46414 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdkn1bP46414 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdkn1bP46414 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdkn1bP46414 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdkn1bP46414 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdkn1bP46414 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdkn1bP46414 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdkn1bP46414 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdkn1bP46414 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdkn1bP46414 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdkn1bP46414 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdkn1bP46414 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdkn1bP46414 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdkn1bP46414 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdkn1bP46414 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdkn1bP46414 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdkn1bP46414 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdkn1bP46414 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdkn1bP46414 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdkn1bP46414 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdkn1bP46414 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdkn1bP46414 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdkn1bP46414 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdkn1bP46414 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdkn1bP46414 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdkn1bP46414 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdkn1bP46414 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdkn1bP46414 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdkn1bP46414 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdkn1bP46414 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdkn1bP46414 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdkn1bP46414 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdkn1bP46414 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdkn1bP46414 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdkn1bP46414 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdkn1bP46414 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdkn1bP46414 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdkn1bP46414 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdkn1bP46414 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdkn1bP46414 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdkn1bP46414 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdkn1bP46414 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdkn1bP46414 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdkn1bP46414 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdkn1bP46414 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdkn1bP46414 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdkn1bP46414 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdkn1bP46414 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdkn1bP46414 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdkn1bP46414 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdkn1bP46414 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdkn1bP46414 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cdkn1bP46414 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdkn1bP46414 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdkn1bP46414 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdkn1bP46414 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdkn1bP46414 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdkn1bP46414 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdkn1bP46414 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdkn1bP46414 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdkn1bP46414 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdkn1bP46414 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdkn1bP46414 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdkn1bP46414 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdkn1bP46414 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdkn1bP46414 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdkn1bP46414 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdkn1bP46414 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdkn1bP46414 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdkn1bP46414 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdkn1bP46414 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdkn1bP46414 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdkn1bP46414 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdkn1bP46414 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdkn1bP46414 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdkn1bP46414 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdkn1bP46414 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdkn1bP46414 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdkn1bP46414 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdkn1bP46414 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdkn1bP46414 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdkn1bP46414 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdkn1bP46414 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 186.7 ms