Protein–RNA interactions for Protein: P41272

Cd27, CD27 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd27P41272 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd27P41272 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd27P41272 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd27P41272 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd27P41272 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd27P41272 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd27P41272 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd27P41272 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd27P41272 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd27P41272 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd27P41272 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd27P41272 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd27P41272 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd27P41272 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd27P41272 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd27P41272 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd27P41272 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd27P41272 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd27P41272 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd27P41272 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd27P41272 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd27P41272 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd27P41272 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd27P41272 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd27P41272 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd27P41272 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd27P41272 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd27P41272 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd27P41272 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd27P41272 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd27P41272 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd27P41272 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd27P41272 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd27P41272 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd27P41272 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd27P41272 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd27P41272 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd27P41272 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd27P41272 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd27P41272 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd27P41272 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd27P41272 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd27P41272 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd27P41272 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd27P41272 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd27P41272 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd27P41272 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd27P41272 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd27P41272 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd27P41272 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd27P41272 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd27P41272 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd27P41272 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd27P41272 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd27P41272 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd27P41272 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd27P41272 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd27P41272 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd27P41272 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd27P41272 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd27P41272 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd27P41272 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd27P41272 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd27P41272 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd27P41272 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd27P41272 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd27P41272 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd27P41272 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd27P41272 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd27P41272 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd27P41272 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd27P41272 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd27P41272 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd27P41272 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd27P41272 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd27P41272 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd27P41272 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd27P41272 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd27P41272 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd27P41272 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd27P41272 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd27P41272 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd27P41272 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd27P41272 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd27P41272 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd27P41272 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd27P41272 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd27P41272 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd27P41272 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd27P41272 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd27P41272 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd27P41272 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd27P41272 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd27P41272 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd27P41272 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd27P41272 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd27P41272 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd27P41272 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd27P41272 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd27P41272 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms