Protein–RNA interactions for Protein: P38647

Hspa9, Stress-70 protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hspa9P38647 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hspa9P38647 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hspa9P38647 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hspa9P38647 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Hspa9P38647 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Hspa9P38647 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hspa9P38647 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hspa9P38647 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hspa9P38647 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hspa9P38647 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hspa9P38647 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hspa9P38647 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hspa9P38647 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hspa9P38647 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hspa9P38647 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Hspa9P38647 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hspa9P38647 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hspa9P38647 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hspa9P38647 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hspa9P38647 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hspa9P38647 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hspa9P38647 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hspa9P38647 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hspa9P38647 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hspa9P38647 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hspa9P38647 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hspa9P38647 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hspa9P38647 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hspa9P38647 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hspa9P38647 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hspa9P38647 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hspa9P38647 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hspa9P38647 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hspa9P38647 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hspa9P38647 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hspa9P38647 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hspa9P38647 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hspa9P38647 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hspa9P38647 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hspa9P38647 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hspa9P38647 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hspa9P38647 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Hspa9P38647 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hspa9P38647 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hspa9P38647 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hspa9P38647 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hspa9P38647 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hspa9P38647 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hspa9P38647 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hspa9P38647 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hspa9P38647 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hspa9P38647 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Hspa9P38647 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hspa9P38647 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hspa9P38647 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hspa9P38647 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hspa9P38647 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hspa9P38647 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hspa9P38647 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hspa9P38647 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hspa9P38647 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hspa9P38647 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hspa9P38647 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hspa9P38647 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hspa9P38647 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hspa9P38647 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hspa9P38647 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hspa9P38647 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hspa9P38647 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hspa9P38647 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Hspa9P38647 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hspa9P38647 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hspa9P38647 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hspa9P38647 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hspa9P38647 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hspa9P38647 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hspa9P38647 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hspa9P38647 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hspa9P38647 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hspa9P38647 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hspa9P38647 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hspa9P38647 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hspa9P38647 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hspa9P38647 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hspa9P38647 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hspa9P38647 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hspa9P38647 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hspa9P38647 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hspa9P38647 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hspa9P38647 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hspa9P38647 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hspa9P38647 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hspa9P38647 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hspa9P38647 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hspa9P38647 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hspa9P38647 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hspa9P38647 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hspa9P38647 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hspa9P38647 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hspa9P38647 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms