Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rom1P32958 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rom1P32958 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rom1P32958 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rom1P32958 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rom1P32958 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rom1P32958 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rom1P32958 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rom1P32958 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rom1P32958 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rom1P32958 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rom1P32958 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rom1P32958 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rom1P32958 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rom1P32958 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rom1P32958 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rom1P32958 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rom1P32958 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rom1P32958 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rom1P32958 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rom1P32958 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rom1P32958 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rom1P32958 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rom1P32958 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rom1P32958 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rom1P32958 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rom1P32958 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rom1P32958 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rom1P32958 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rom1P32958 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rom1P32958 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rom1P32958 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rom1P32958 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rom1P32958 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rom1P32958 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rom1P32958 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rom1P32958 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rom1P32958 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rom1P32958 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rom1P32958 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rom1P32958 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rom1P32958 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rom1P32958 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rom1P32958 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rom1P32958 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rom1P32958 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rom1P32958 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rom1P32958 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rom1P32958 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rom1P32958 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rom1P32958 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rom1P32958 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rom1P32958 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rom1P32958 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rom1P32958 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Rom1P32958 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Rom1P32958 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rom1P32958 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rom1P32958 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rom1P32958 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rom1P32958 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rom1P32958 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rom1P32958 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rom1P32958 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rom1P32958 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rom1P32958 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rom1P32958 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rom1P32958 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rom1P32958 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rom1P32958 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rom1P32958 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rom1P32958 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rom1P32958 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rom1P32958 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rom1P32958 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rom1P32958 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rom1P32958 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rom1P32958 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rom1P32958 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rom1P32958 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rom1P32958 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rom1P32958 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rom1P32958 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rom1P32958 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rom1P32958 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rom1P32958 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rom1P32958 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rom1P32958 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rom1P32958 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rom1P32958 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rom1P32958 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rom1P32958 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rom1P32958 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rom1P32958 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rom1P32958 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rom1P32958 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rom1P32958 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rom1P32958 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rom1P32958 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rom1P32958 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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