Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxc10P31257 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxc10P31257 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxc10P31257 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxc10P31257 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxc10P31257 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxc10P31257 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxc10P31257 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxc10P31257 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxc10P31257 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxc10P31257 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxc10P31257 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxc10P31257 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxc10P31257 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxc10P31257 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxc10P31257 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxc10P31257 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxc10P31257 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxc10P31257 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxc10P31257 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxc10P31257 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxc10P31257 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxc10P31257 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxc10P31257 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxc10P31257 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxc10P31257 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxc10P31257 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxc10P31257 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxc10P31257 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxc10P31257 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxc10P31257 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxc10P31257 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxc10P31257 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxc10P31257 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxc10P31257 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxc10P31257 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxc10P31257 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxc10P31257 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxc10P31257 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxc10P31257 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxc10P31257 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxc10P31257 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxc10P31257 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxc10P31257 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxc10P31257 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxc10P31257 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxc10P31257 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxc10P31257 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxc10P31257 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxc10P31257 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxc10P31257 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxc10P31257 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxc10P31257 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxc10P31257 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxc10P31257 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxc10P31257 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxc10P31257 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxc10P31257 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxc10P31257 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxc10P31257 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxc10P31257 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxc10P31257 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxc10P31257 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxc10P31257 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxc10P31257 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxc10P31257 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxc10P31257 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxc10P31257 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxc10P31257 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxc10P31257 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxc10P31257 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxc10P31257 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxc10P31257 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxc10P31257 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxc10P31257 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxc10P31257 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxc10P31257 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxc10P31257 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxc10P31257 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxc10P31257 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hoxc10P31257 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Hoxc10P31257 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxc10P31257 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxc10P31257 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxc10P31257 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxc10P31257 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxc10P31257 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxc10P31257 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxc10P31257 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxc10P31257 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxc10P31257 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxc10P31257 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxc10P31257 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxc10P31257 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxc10P31257 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxc10P31257 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxc10P31257 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxc10P31257 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxc10P31257 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxc10P31257 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 148.6 ms