Protein–RNA interactions for Protein: P21107

Tpm3, Tropomyosin alpha-3 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3P21107 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Tpm3P21107 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tpm3P21107 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tpm3P21107 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tpm3P21107 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tpm3P21107 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tpm3P21107 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tpm3P21107 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tpm3P21107 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tpm3P21107 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tpm3P21107 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tpm3P21107 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tpm3P21107 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tpm3P21107 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tpm3P21107 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tpm3P21107 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tpm3P21107 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tpm3P21107 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tpm3P21107 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tpm3P21107 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tpm3P21107 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tpm3P21107 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tpm3P21107 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tpm3P21107 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tpm3P21107 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tpm3P21107 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tpm3P21107 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tpm3P21107 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tpm3P21107 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tpm3P21107 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tpm3P21107 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tpm3P21107 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tpm3P21107 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tpm3P21107 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tpm3P21107 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tpm3P21107 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tpm3P21107 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tpm3P21107 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tpm3P21107 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tpm3P21107 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tpm3P21107 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tpm3P21107 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tpm3P21107 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tpm3P21107 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tpm3P21107 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tpm3P21107 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tpm3P21107 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tpm3P21107 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tpm3P21107 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tpm3P21107 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tpm3P21107 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tpm3P21107 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tpm3P21107 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tpm3P21107 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tpm3P21107 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tpm3P21107 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tpm3P21107 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tpm3P21107 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tpm3P21107 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tpm3P21107 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tpm3P21107 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tpm3P21107 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tpm3P21107 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tpm3P21107 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tpm3P21107 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tpm3P21107 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tpm3P21107 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tpm3P21107 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tpm3P21107 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tpm3P21107 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tpm3P21107 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tpm3P21107 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tpm3P21107 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tpm3P21107 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tpm3P21107 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tpm3P21107 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tpm3P21107 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tpm3P21107 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tpm3P21107 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tpm3P21107 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tpm3P21107 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tpm3P21107 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tpm3P21107 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tpm3P21107 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tpm3P21107 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tpm3P21107 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tpm3P21107 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tpm3P21107 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tpm3P21107 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tpm3P21107 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tpm3P21107 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tpm3P21107 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tpm3P21107 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tpm3P21107 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tpm3P21107 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tpm3P21107 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tpm3P21107 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tpm3P21107 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tpm3P21107 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tpm3P21107 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms