Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PtpraP18052 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PtpraP18052 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PtpraP18052 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PtpraP18052 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PtpraP18052 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PtpraP18052 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PtpraP18052 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PtpraP18052 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PtpraP18052 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PtpraP18052 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtpraP18052 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtpraP18052 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtpraP18052 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PtpraP18052 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtpraP18052 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtpraP18052 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtpraP18052 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtpraP18052 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtpraP18052 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtpraP18052 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtpraP18052 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtpraP18052 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtpraP18052 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtpraP18052 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtpraP18052 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtpraP18052 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtpraP18052 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtpraP18052 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtpraP18052 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtpraP18052 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtpraP18052 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtpraP18052 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtpraP18052 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtpraP18052 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtpraP18052 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtpraP18052 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtpraP18052 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtpraP18052 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtpraP18052 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtpraP18052 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtpraP18052 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtpraP18052 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtpraP18052 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtpraP18052 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtpraP18052 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtpraP18052 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtpraP18052 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PtpraP18052 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtpraP18052 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtpraP18052 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PtpraP18052 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PtpraP18052 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PtpraP18052 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PtpraP18052 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PtpraP18052 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PtpraP18052 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PtpraP18052 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PtpraP18052 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PtpraP18052 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtpraP18052 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtpraP18052 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtpraP18052 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtpraP18052 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PtpraP18052 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtpraP18052 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtpraP18052 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtpraP18052 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtpraP18052 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtpraP18052 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtpraP18052 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtpraP18052 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtpraP18052 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtpraP18052 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtpraP18052 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtpraP18052 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtpraP18052 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtpraP18052 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PtpraP18052 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PtpraP18052 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PtpraP18052 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PtpraP18052 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PtpraP18052 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PtpraP18052 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtpraP18052 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtpraP18052 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtpraP18052 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PtpraP18052 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtpraP18052 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtpraP18052 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtpraP18052 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PtpraP18052 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PtpraP18052 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PtpraP18052 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PtpraP18052 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PtpraP18052 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PtpraP18052 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PtpraP18052 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PtpraP18052 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PtpraP18052 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
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