Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RhoP15409 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RhoP15409 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RhoP15409 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RhoP15409 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RhoP15409 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RhoP15409 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RhoP15409 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
RhoP15409 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RhoP15409 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RhoP15409 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RhoP15409 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RhoP15409 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RhoP15409 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RhoP15409 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RhoP15409 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RhoP15409 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RhoP15409 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RhoP15409 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RhoP15409 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RhoP15409 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RhoP15409 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RhoP15409 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RhoP15409 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RhoP15409 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RhoP15409 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RhoP15409 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RhoP15409 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RhoP15409 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RhoP15409 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RhoP15409 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RhoP15409 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RhoP15409 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RhoP15409 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RhoP15409 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RhoP15409 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RhoP15409 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RhoP15409 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RhoP15409 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RhoP15409 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RhoP15409 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RhoP15409 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RhoP15409 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RhoP15409 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RhoP15409 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RhoP15409 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RhoP15409 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RhoP15409 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RhoP15409 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RhoP15409 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RhoP15409 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RhoP15409 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RhoP15409 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RhoP15409 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RhoP15409 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RhoP15409 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RhoP15409 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RhoP15409 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RhoP15409 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RhoP15409 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RhoP15409 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RhoP15409 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RhoP15409 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RhoP15409 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RhoP15409 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RhoP15409 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RhoP15409 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RhoP15409 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RhoP15409 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RhoP15409 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RhoP15409 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RhoP15409 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RhoP15409 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RhoP15409 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RhoP15409 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RhoP15409 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RhoP15409 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RhoP15409 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RhoP15409 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RhoP15409 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RhoP15409 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RhoP15409 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RhoP15409 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RhoP15409 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RhoP15409 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RhoP15409 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RhoP15409 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RhoP15409 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RhoP15409 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RhoP15409 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RhoP15409 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RhoP15409 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RhoP15409 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RhoP15409 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RhoP15409 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RhoP15409 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RhoP15409 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RhoP15409 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RhoP15409 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RhoP15409 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77 ms