Protein–RNA interactions for Protein: P13379

Cd5, T-cell surface glycoprotein CD5, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd5P13379 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd5P13379 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cd5P13379 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cd5P13379 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cd5P13379 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cd5P13379 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cd5P13379 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cd5P13379 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cd5P13379 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Cd5P13379 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cd5P13379 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cd5P13379 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cd5P13379 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cd5P13379 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cd5P13379 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cd5P13379 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cd5P13379 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cd5P13379 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cd5P13379 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cd5P13379 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cd5P13379 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cd5P13379 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cd5P13379 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cd5P13379 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cd5P13379 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cd5P13379 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cd5P13379 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cd5P13379 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cd5P13379 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cd5P13379 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cd5P13379 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cd5P13379 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cd5P13379 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Cd5P13379 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cd5P13379 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cd5P13379 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cd5P13379 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cd5P13379 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cd5P13379 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cd5P13379 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cd5P13379 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cd5P13379 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cd5P13379 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cd5P13379 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cd5P13379 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cd5P13379 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cd5P13379 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cd5P13379 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cd5P13379 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cd5P13379 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cd5P13379 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cd5P13379 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cd5P13379 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cd5P13379 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cd5P13379 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cd5P13379 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Cd5P13379 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cd5P13379 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cd5P13379 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cd5P13379 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cd5P13379 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cd5P13379 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cd5P13379 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cd5P13379 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cd5P13379 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cd5P13379 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cd5P13379 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cd5P13379 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cd5P13379 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cd5P13379 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cd5P13379 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cd5P13379 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cd5P13379 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cd5P13379 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Cd5P13379 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cd5P13379 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cd5P13379 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cd5P13379 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cd5P13379 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cd5P13379 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cd5P13379 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cd5P13379 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cd5P13379 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cd5P13379 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cd5P13379 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cd5P13379 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cd5P13379 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cd5P13379 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cd5P13379 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cd5P13379 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cd5P13379 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cd5P13379 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cd5P13379 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cd5P13379 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cd5P13379 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cd5P13379 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cd5P13379 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cd5P13379 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cd5P13379 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Cd5P13379 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms