Protein–RNA interactions for Protein: P01797

Ig heavy chain V-III region U61, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01797 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01797 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01797 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01797 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01797 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01797 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
P01797 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01797 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01797 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01797 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01797 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01797 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01797 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
P01797 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01797 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01797 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01797 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01797 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01797 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01797 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01797 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01797 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
P01797 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01797 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01797 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01797 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01797 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01797 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01797 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01797 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01797 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01797 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01797 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01797 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01797 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01797 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01797 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01797 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01797 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01797 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01797 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01797 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01797 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01797 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01797 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
P01797 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01797 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01797 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01797 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01797 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
P01797 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01797 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
P01797 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.22
P01797 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01797 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01797 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01797 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01797 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01797 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
P01797 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01797 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01797 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01797 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01797 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01797 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01797 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01797 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01797 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01797 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01797 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01797 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01797 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01797 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01797 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01797 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01797 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01797 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01797 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01797 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01797 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01797 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01797 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01797 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01797 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01797 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01797 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
P01797 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
P01797 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01797 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01797 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01797 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01797 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01797 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01797 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01797 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01797 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01797 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01797 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01797 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01797 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms