Protein–RNA interactions for Protein: P01725

Ig lambda-1 chain V region S178, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01725 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01725 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01725 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01725 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01725 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01725 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01725 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
P01725 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01725 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01725 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01725 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
P01725 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01725 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01725 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01725 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01725 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01725 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01725 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01725 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01725 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01725 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01725 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01725 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01725 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
P01725 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01725 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01725 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01725 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01725 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01725 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01725 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01725 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01725 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01725 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01725 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01725 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01725 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01725 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01725 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01725 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01725 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
P01725 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01725 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01725 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01725 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01725 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
P01725 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01725 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01725 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01725 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01725 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01725 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01725 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01725 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01725 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01725 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01725 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01725 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01725 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01725 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01725 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01725 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01725 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01725 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01725 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01725 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01725 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01725 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01725 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01725 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01725 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01725 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
P01725 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
P01725 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01725 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01725 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01725 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01725 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01725 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01725 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01725 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01725 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01725 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
P01725 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
P01725 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01725 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01725 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01725 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01725 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01725 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01725 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01725 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01725 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01725 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01725 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01725 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01725 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01725 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01725 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01725 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms