Protein–RNA interactions for Protein: P01679

Ig kappa chain V-VI region J539, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01679 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
P01679 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
P01679 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
P01679 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
P01679 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
P01679 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
P01679 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
P01679 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
P01679 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
P01679 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
P01679 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
P01679 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
P01679 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
P01679 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
P01679 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
P01679 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
P01679 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
P01679 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
P01679 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
P01679 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
P01679 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
P01679 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
P01679 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
P01679 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
P01679 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
P01679 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
P01679 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
P01679 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
P01679 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
P01679 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
P01679 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
P01679 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
P01679 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
P01679 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
P01679 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
P01679 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
P01679 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
P01679 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
P01679 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
P01679 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
P01679 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
P01679 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
P01679 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
P01679 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
P01679 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
P01679 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
P01679 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
P01679 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
P01679 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
P01679 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
P01679 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
P01679 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
P01679 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
P01679 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
P01679 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
P01679 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
P01679 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
P01679 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
P01679 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
P01679 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
P01679 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
P01679 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
P01679 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
P01679 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
P01679 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
P01679 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
P01679 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
P01679 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
P01679 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
P01679 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
P01679 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
P01679 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
P01679 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
P01679 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
P01679 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
P01679 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
P01679 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
P01679 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
P01679 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
P01679 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
P01679 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
P01679 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
P01679 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
P01679 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
P01679 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
P01679 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
P01679 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
P01679 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
P01679 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
P01679 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
P01679 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
P01679 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
P01679 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
P01679 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
P01679 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
P01679 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
P01679 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
P01679 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
P01679 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
P01679 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms