Protein–RNA interactions for Protein: P01678

Ig kappa chain V-VI region SAPC 10, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01678 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
P01678 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
P01678 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
P01678 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
P01678 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
P01678 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
P01678 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
P01678 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
P01678 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
P01678 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
P01678 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
P01678 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
P01678 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
P01678 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
P01678 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
P01678 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
P01678 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
P01678 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
P01678 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
P01678 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
P01678 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
P01678 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
P01678 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
P01678 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
P01678 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
P01678 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
P01678 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
P01678 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
P01678 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
P01678 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
P01678 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
P01678 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
P01678 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
P01678 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
P01678 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
P01678 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
P01678 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
P01678 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
P01678 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
P01678 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
P01678 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
P01678 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
P01678 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
P01678 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
P01678 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
P01678 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
P01678 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
P01678 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
P01678 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
P01678 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
P01678 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
P01678 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
P01678 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
P01678 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
P01678 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
P01678 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
P01678 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
P01678 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
P01678 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
P01678 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
P01678 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
P01678 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
P01678 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
P01678 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
P01678 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
P01678 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
P01678 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
P01678 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
P01678 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
P01678 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
P01678 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
P01678 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
P01678 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
P01678 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
P01678 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
P01678 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
P01678 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
P01678 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
P01678 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
P01678 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
P01678 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
P01678 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
P01678 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
P01678 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
P01678 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
P01678 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
P01678 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
P01678 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
P01678 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
P01678 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
P01678 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
P01678 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
P01678 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
P01678 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
P01678 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
P01678 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
P01678 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
P01678 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
P01678 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
P01678 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms