Protein–RNA interactions for Protein: O88983

Stx8, Syntaxin-8, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx8O88983 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Stx8O88983 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stx8O88983 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stx8O88983 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stx8O88983 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stx8O88983 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stx8O88983 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stx8O88983 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stx8O88983 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stx8O88983 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stx8O88983 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stx8O88983 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stx8O88983 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stx8O88983 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stx8O88983 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stx8O88983 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Stx8O88983 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Stx8O88983 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Stx8O88983 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Stx8O88983 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Stx8O88983 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Stx8O88983 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Stx8O88983 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Stx8O88983 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Stx8O88983 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Stx8O88983 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Stx8O88983 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Stx8O88983 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Stx8O88983 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Stx8O88983 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Stx8O88983 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Stx8O88983 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Stx8O88983 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Stx8O88983 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Stx8O88983 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Stx8O88983 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Stx8O88983 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Stx8O88983 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Stx8O88983 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Stx8O88983 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Stx8O88983 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Stx8O88983 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Stx8O88983 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Stx8O88983 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Stx8O88983 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Stx8O88983 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Stx8O88983 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Stx8O88983 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Stx8O88983 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Stx8O88983 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Stx8O88983 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Stx8O88983 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Stx8O88983 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Stx8O88983 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Stx8O88983 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Stx8O88983 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Stx8O88983 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Stx8O88983 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Stx8O88983 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Stx8O88983 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Stx8O88983 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Stx8O88983 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Stx8O88983 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Stx8O88983 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Stx8O88983 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Stx8O88983 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Stx8O88983 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Stx8O88983 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Stx8O88983 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Stx8O88983 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Stx8O88983 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Stx8O88983 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Stx8O88983 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Stx8O88983 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Stx8O88983 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Stx8O88983 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Stx8O88983 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Stx8O88983 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Stx8O88983 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Stx8O88983 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Stx8O88983 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Stx8O88983 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Stx8O88983 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Stx8O88983 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Stx8O88983 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Stx8O88983 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Stx8O88983 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Stx8O88983 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Stx8O88983 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Stx8O88983 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Stx8O88983 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Stx8O88983 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Stx8O88983 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Stx8O88983 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Stx8O88983 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Stx8O88983 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Stx8O88983 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Stx8O88983 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Stx8O88983 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Stx8O88983 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms