Protein–RNA interactions for Protein: O35955

Psmb10, Proteasome subunit beta type-10, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb10O35955 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Psmb10O35955 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Psmb10O35955 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Psmb10O35955 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Psmb10O35955 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Psmb10O35955 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Psmb10O35955 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Psmb10O35955 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Psmb10O35955 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Psmb10O35955 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Psmb10O35955 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Psmb10O35955 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Psmb10O35955 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Psmb10O35955 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Psmb10O35955 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Psmb10O35955 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psmb10O35955 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psmb10O35955 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psmb10O35955 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psmb10O35955 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psmb10O35955 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psmb10O35955 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psmb10O35955 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psmb10O35955 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psmb10O35955 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psmb10O35955 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psmb10O35955 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psmb10O35955 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psmb10O35955 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Psmb10O35955 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Psmb10O35955 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Psmb10O35955 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Psmb10O35955 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Psmb10O35955 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Psmb10O35955 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Psmb10O35955 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Psmb10O35955 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Psmb10O35955 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psmb10O35955 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psmb10O35955 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psmb10O35955 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psmb10O35955 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psmb10O35955 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psmb10O35955 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psmb10O35955 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psmb10O35955 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psmb10O35955 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psmb10O35955 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psmb10O35955 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psmb10O35955 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psmb10O35955 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psmb10O35955 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psmb10O35955 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psmb10O35955 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psmb10O35955 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psmb10O35955 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psmb10O35955 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Psmb10O35955 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psmb10O35955 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psmb10O35955 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psmb10O35955 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Psmb10O35955 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Psmb10O35955 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Psmb10O35955 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Psmb10O35955 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Psmb10O35955 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Psmb10O35955 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Psmb10O35955 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psmb10O35955 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psmb10O35955 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psmb10O35955 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psmb10O35955 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Psmb10O35955 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psmb10O35955 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psmb10O35955 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psmb10O35955 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psmb10O35955 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psmb10O35955 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psmb10O35955 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psmb10O35955 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psmb10O35955 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psmb10O35955 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psmb10O35955 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psmb10O35955 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psmb10O35955 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psmb10O35955 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psmb10O35955 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psmb10O35955 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psmb10O35955 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psmb10O35955 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psmb10O35955 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psmb10O35955 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psmb10O35955 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psmb10O35955 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Psmb10O35955 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psmb10O35955 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psmb10O35955 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psmb10O35955 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psmb10O35955 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psmb10O35955 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms