Protein–RNA interactions for Protein: L7MTU6

Ifnab, Interferon alpha B, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnabL7MTU6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IfnabL7MTU6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IfnabL7MTU6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IfnabL7MTU6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IfnabL7MTU6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IfnabL7MTU6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IfnabL7MTU6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IfnabL7MTU6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IfnabL7MTU6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IfnabL7MTU6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IfnabL7MTU6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IfnabL7MTU6 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IfnabL7MTU6 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IfnabL7MTU6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IfnabL7MTU6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IfnabL7MTU6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IfnabL7MTU6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IfnabL7MTU6 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IfnabL7MTU6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IfnabL7MTU6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IfnabL7MTU6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IfnabL7MTU6 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IfnabL7MTU6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IfnabL7MTU6 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IfnabL7MTU6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IfnabL7MTU6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IfnabL7MTU6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IfnabL7MTU6 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IfnabL7MTU6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
IfnabL7MTU6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
IfnabL7MTU6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IfnabL7MTU6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IfnabL7MTU6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IfnabL7MTU6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IfnabL7MTU6 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IfnabL7MTU6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IfnabL7MTU6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IfnabL7MTU6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IfnabL7MTU6 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IfnabL7MTU6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IfnabL7MTU6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IfnabL7MTU6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IfnabL7MTU6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IfnabL7MTU6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IfnabL7MTU6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
IfnabL7MTU6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IfnabL7MTU6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IfnabL7MTU6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IfnabL7MTU6 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IfnabL7MTU6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IfnabL7MTU6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IfnabL7MTU6 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IfnabL7MTU6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IfnabL7MTU6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IfnabL7MTU6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IfnabL7MTU6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IfnabL7MTU6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IfnabL7MTU6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IfnabL7MTU6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IfnabL7MTU6 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IfnabL7MTU6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IfnabL7MTU6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IfnabL7MTU6 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IfnabL7MTU6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IfnabL7MTU6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IfnabL7MTU6 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IfnabL7MTU6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IfnabL7MTU6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IfnabL7MTU6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IfnabL7MTU6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IfnabL7MTU6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IfnabL7MTU6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
IfnabL7MTU6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IfnabL7MTU6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IfnabL7MTU6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IfnabL7MTU6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IfnabL7MTU6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IfnabL7MTU6 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IfnabL7MTU6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IfnabL7MTU6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IfnabL7MTU6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IfnabL7MTU6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IfnabL7MTU6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IfnabL7MTU6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IfnabL7MTU6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IfnabL7MTU6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IfnabL7MTU6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
IfnabL7MTU6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IfnabL7MTU6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IfnabL7MTU6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IfnabL7MTU6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IfnabL7MTU6 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IfnabL7MTU6 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IfnabL7MTU6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IfnabL7MTU6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IfnabL7MTU6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IfnabL7MTU6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IfnabL7MTU6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IfnabL7MTU6 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
IfnabL7MTU6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.6 ms