Protein–RNA interactions for Protein: J3QP38

Gm21900, Predicted gene, 21900, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21900J3QP38 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21900J3QP38 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21900J3QP38 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21900J3QP38 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21900J3QP38 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21900J3QP38 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21900J3QP38 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21900J3QP38 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21900J3QP38 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21900J3QP38 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21900J3QP38 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21900J3QP38 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21900J3QP38 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21900J3QP38 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21900J3QP38 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21900J3QP38 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21900J3QP38 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21900J3QP38 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21900J3QP38 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21900J3QP38 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21900J3QP38 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21900J3QP38 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21900J3QP38 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21900J3QP38 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21900J3QP38 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21900J3QP38 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21900J3QP38 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
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Gm21900J3QP38 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21900J3QP38 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21900J3QP38 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21900J3QP38 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21900J3QP38 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21900J3QP38 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21900J3QP38 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21900J3QP38 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21900J3QP38 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21900J3QP38 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21900J3QP38 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21900J3QP38 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21900J3QP38 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21900J3QP38 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21900J3QP38 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21900J3QP38 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21900J3QP38 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21900J3QP38 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21900J3QP38 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21900J3QP38 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21900J3QP38 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm21900J3QP38 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm21900J3QP38 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm21900J3QP38 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Gm21900J3QP38 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21900J3QP38 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21900J3QP38 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Gm21900J3QP38 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21900J3QP38 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21900J3QP38 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21900J3QP38 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21900J3QP38 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21900J3QP38 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21900J3QP38 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21900J3QP38 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21900J3QP38 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21900J3QP38 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21900J3QP38 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21900J3QP38 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21900J3QP38 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21900J3QP38 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21900J3QP38 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21900J3QP38 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21900J3QP38 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21900J3QP38 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21900J3QP38 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21900J3QP38 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21900J3QP38 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21900J3QP38 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21900J3QP38 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21900J3QP38 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21900J3QP38 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21900J3QP38 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21900J3QP38 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21900J3QP38 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21900J3QP38 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21900J3QP38 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21900J3QP38 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21900J3QP38 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21900J3QP38 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21900J3QP38 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21900J3QP38 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21900J3QP38 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21900J3QP38 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21900J3QP38 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21900J3QP38 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21900J3QP38 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21900J3QP38 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21900J3QP38 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21900J3QP38 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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