Protein–RNA interactions for Protein: J3QNS5

Mfsd4b4, Major facilitator superfamily domain-containing 4B4, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd4b4J3QNS5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mfsd4b4J3QNS5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mfsd4b4J3QNS5 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mfsd4b4J3QNS5 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mfsd4b4J3QNS5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mfsd4b4J3QNS5 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mfsd4b4J3QNS5 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mfsd4b4J3QNS5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mfsd4b4J3QNS5 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mfsd4b4J3QNS5 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mfsd4b4J3QNS5 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mfsd4b4J3QNS5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Mfsd4b4J3QNS5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mfsd4b4J3QNS5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mfsd4b4J3QNS5 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mfsd4b4J3QNS5 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mfsd4b4J3QNS5 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mfsd4b4J3QNS5 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Mfsd4b4J3QNS5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mfsd4b4J3QNS5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mfsd4b4J3QNS5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mfsd4b4J3QNS5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mfsd4b4J3QNS5 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mfsd4b4J3QNS5 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mfsd4b4J3QNS5 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Mfsd4b4J3QNS5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mfsd4b4J3QNS5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mfsd4b4J3QNS5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mfsd4b4J3QNS5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mfsd4b4J3QNS5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mfsd4b4J3QNS5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mfsd4b4J3QNS5 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mfsd4b4J3QNS5 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mfsd4b4J3QNS5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mfsd4b4J3QNS5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mfsd4b4J3QNS5 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mfsd4b4J3QNS5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mfsd4b4J3QNS5 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mfsd4b4J3QNS5 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mfsd4b4J3QNS5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mfsd4b4J3QNS5 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mfsd4b4J3QNS5 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mfsd4b4J3QNS5 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mfsd4b4J3QNS5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mfsd4b4J3QNS5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mfsd4b4J3QNS5 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mfsd4b4J3QNS5 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mfsd4b4J3QNS5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mfsd4b4J3QNS5 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mfsd4b4J3QNS5 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mfsd4b4J3QNS5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mfsd4b4J3QNS5 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mfsd4b4J3QNS5 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mfsd4b4J3QNS5 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mfsd4b4J3QNS5 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Mfsd4b4J3QNS5 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mfsd4b4J3QNS5 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mfsd4b4J3QNS5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Mfsd4b4J3QNS5 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mfsd4b4J3QNS5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mfsd4b4J3QNS5 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mfsd4b4J3QNS5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mfsd4b4J3QNS5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mfsd4b4J3QNS5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mfsd4b4J3QNS5 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mfsd4b4J3QNS5 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mfsd4b4J3QNS5 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mfsd4b4J3QNS5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mfsd4b4J3QNS5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mfsd4b4J3QNS5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mfsd4b4J3QNS5 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mfsd4b4J3QNS5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mfsd4b4J3QNS5 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mfsd4b4J3QNS5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mfsd4b4J3QNS5 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mfsd4b4J3QNS5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mfsd4b4J3QNS5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mfsd4b4J3QNS5 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mfsd4b4J3QNS5 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mfsd4b4J3QNS5 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mfsd4b4J3QNS5 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mfsd4b4J3QNS5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mfsd4b4J3QNS5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mfsd4b4J3QNS5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mfsd4b4J3QNS5 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mfsd4b4J3QNS5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mfsd4b4J3QNS5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mfsd4b4J3QNS5 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mfsd4b4J3QNS5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mfsd4b4J3QNS5 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mfsd4b4J3QNS5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mfsd4b4J3QNS5 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mfsd4b4J3QNS5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Mfsd4b4J3QNS5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Mfsd4b4J3QNS5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mfsd4b4J3QNS5 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mfsd4b4J3QNS5 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mfsd4b4J3QNS5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mfsd4b4J3QNS5 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mfsd4b4J3QNS5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.4 ms