Protein–RNA interactions for Protein: G3X964

2610008E11Rik, RIKEN cDNA 2610008E11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610008E11RikG3X964 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
2610008E11RikG3X964 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
2610008E11RikG3X964 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
2610008E11RikG3X964 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
2610008E11RikG3X964 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
2610008E11RikG3X964 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
2610008E11RikG3X964 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
2610008E11RikG3X964 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
2610008E11RikG3X964 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
2610008E11RikG3X964 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
2610008E11RikG3X964 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
2610008E11RikG3X964 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
2610008E11RikG3X964 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
2610008E11RikG3X964 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
2610008E11RikG3X964 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
2610008E11RikG3X964 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
2610008E11RikG3X964 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
2610008E11RikG3X964 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
2610008E11RikG3X964 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
2610008E11RikG3X964 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
2610008E11RikG3X964 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
2610008E11RikG3X964 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
2610008E11RikG3X964 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
2610008E11RikG3X964 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
2610008E11RikG3X964 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
2610008E11RikG3X964 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
2610008E11RikG3X964 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
2610008E11RikG3X964 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
2610008E11RikG3X964 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
2610008E11RikG3X964 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
2610008E11RikG3X964 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
2610008E11RikG3X964 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
2610008E11RikG3X964 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
2610008E11RikG3X964 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
2610008E11RikG3X964 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
2610008E11RikG3X964 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
2610008E11RikG3X964 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
2610008E11RikG3X964 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
2610008E11RikG3X964 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
2610008E11RikG3X964 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
2610008E11RikG3X964 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
2610008E11RikG3X964 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
2610008E11RikG3X964 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
2610008E11RikG3X964 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
2610008E11RikG3X964 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
2610008E11RikG3X964 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
2610008E11RikG3X964 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
2610008E11RikG3X964 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
2610008E11RikG3X964 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
2610008E11RikG3X964 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
2610008E11RikG3X964 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
2610008E11RikG3X964 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
2610008E11RikG3X964 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
2610008E11RikG3X964 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
2610008E11RikG3X964 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
2610008E11RikG3X964 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
2610008E11RikG3X964 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
2610008E11RikG3X964 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
2610008E11RikG3X964 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
2610008E11RikG3X964 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
2610008E11RikG3X964 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
2610008E11RikG3X964 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
2610008E11RikG3X964 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
2610008E11RikG3X964 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
2610008E11RikG3X964 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
2610008E11RikG3X964 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
2610008E11RikG3X964 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
2610008E11RikG3X964 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
2610008E11RikG3X964 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
2610008E11RikG3X964 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
2610008E11RikG3X964 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
2610008E11RikG3X964 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
2610008E11RikG3X964 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
2610008E11RikG3X964 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
2610008E11RikG3X964 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
2610008E11RikG3X964 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
2610008E11RikG3X964 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
2610008E11RikG3X964 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
2610008E11RikG3X964 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
2610008E11RikG3X964 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
2610008E11RikG3X964 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
2610008E11RikG3X964 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
2610008E11RikG3X964 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
2610008E11RikG3X964 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
2610008E11RikG3X964 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
2610008E11RikG3X964 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
2610008E11RikG3X964 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
2610008E11RikG3X964 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
2610008E11RikG3X964 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
2610008E11RikG3X964 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
2610008E11RikG3X964 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
2610008E11RikG3X964 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
2610008E11RikG3X964 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
2610008E11RikG3X964 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
2610008E11RikG3X964 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
2610008E11RikG3X964 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
2610008E11RikG3X964 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
2610008E11RikG3X964 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
2610008E11RikG3X964 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
2610008E11RikG3X964 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms