Protein–RNA interactions for Protein: F6YH22

Gm5218, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5218F6YH22 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5218F6YH22 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5218F6YH22 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5218F6YH22 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5218F6YH22 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5218F6YH22 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5218F6YH22 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5218F6YH22 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5218F6YH22 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5218F6YH22 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5218F6YH22 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5218F6YH22 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5218F6YH22 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5218F6YH22 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5218F6YH22 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5218F6YH22 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5218F6YH22 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5218F6YH22 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5218F6YH22 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5218F6YH22 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5218F6YH22 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5218F6YH22 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5218F6YH22 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5218F6YH22 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5218F6YH22 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5218F6YH22 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5218F6YH22 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5218F6YH22 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5218F6YH22 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5218F6YH22 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5218F6YH22 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5218F6YH22 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5218F6YH22 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5218F6YH22 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5218F6YH22 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5218F6YH22 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5218F6YH22 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5218F6YH22 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5218F6YH22 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5218F6YH22 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5218F6YH22 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5218F6YH22 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5218F6YH22 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5218F6YH22 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5218F6YH22 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5218F6YH22 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5218F6YH22 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5218F6YH22 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm5218F6YH22 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm5218F6YH22 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm5218F6YH22 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5218F6YH22 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5218F6YH22 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5218F6YH22 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5218F6YH22 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5218F6YH22 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5218F6YH22 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5218F6YH22 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5218F6YH22 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5218F6YH22 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5218F6YH22 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5218F6YH22 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5218F6YH22 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5218F6YH22 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5218F6YH22 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5218F6YH22 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5218F6YH22 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5218F6YH22 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5218F6YH22 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5218F6YH22 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5218F6YH22 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5218F6YH22 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5218F6YH22 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5218F6YH22 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5218F6YH22 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5218F6YH22 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5218F6YH22 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5218F6YH22 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5218F6YH22 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5218F6YH22 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5218F6YH22 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5218F6YH22 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5218F6YH22 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5218F6YH22 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5218F6YH22 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5218F6YH22 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5218F6YH22 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5218F6YH22 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5218F6YH22 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5218F6YH22 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5218F6YH22 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5218F6YH22 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5218F6YH22 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5218F6YH22 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5218F6YH22 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5218F6YH22 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5218F6YH22 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5218F6YH22 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5218F6YH22 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5218F6YH22 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms