Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P2

Cacna1i, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 2,199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1iE9Q7P2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna1iE9Q7P2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna1iE9Q7P2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna1iE9Q7P2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1iE9Q7P2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1iE9Q7P2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1iE9Q7P2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1iE9Q7P2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1iE9Q7P2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1iE9Q7P2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1iE9Q7P2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1iE9Q7P2 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1iE9Q7P2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1iE9Q7P2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1iE9Q7P2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1iE9Q7P2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1iE9Q7P2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1iE9Q7P2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna1iE9Q7P2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna1iE9Q7P2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna1iE9Q7P2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna1iE9Q7P2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna1iE9Q7P2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna1iE9Q7P2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna1iE9Q7P2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna1iE9Q7P2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna1iE9Q7P2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna1iE9Q7P2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna1iE9Q7P2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna1iE9Q7P2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1iE9Q7P2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1iE9Q7P2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1iE9Q7P2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1iE9Q7P2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1iE9Q7P2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1iE9Q7P2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1iE9Q7P2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1iE9Q7P2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1iE9Q7P2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1iE9Q7P2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1iE9Q7P2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1iE9Q7P2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1iE9Q7P2 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1iE9Q7P2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1iE9Q7P2 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1iE9Q7P2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1iE9Q7P2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1iE9Q7P2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1iE9Q7P2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1iE9Q7P2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1iE9Q7P2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1iE9Q7P2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1iE9Q7P2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1iE9Q7P2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1iE9Q7P2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1iE9Q7P2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1iE9Q7P2 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1iE9Q7P2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1iE9Q7P2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacna1iE9Q7P2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacna1iE9Q7P2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacna1iE9Q7P2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacna1iE9Q7P2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacna1iE9Q7P2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacna1iE9Q7P2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna1iE9Q7P2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna1iE9Q7P2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna1iE9Q7P2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna1iE9Q7P2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna1iE9Q7P2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna1iE9Q7P2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna1iE9Q7P2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna1iE9Q7P2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna1iE9Q7P2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna1iE9Q7P2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna1iE9Q7P2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna1iE9Q7P2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna1iE9Q7P2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1iE9Q7P2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1iE9Q7P2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1iE9Q7P2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1iE9Q7P2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1iE9Q7P2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1iE9Q7P2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1iE9Q7P2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1iE9Q7P2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1iE9Q7P2 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1iE9Q7P2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna1iE9Q7P2 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna1iE9Q7P2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna1iE9Q7P2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna1iE9Q7P2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna1iE9Q7P2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna1iE9Q7P2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna1iE9Q7P2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna1iE9Q7P2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna1iE9Q7P2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna1iE9Q7P2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna1iE9Q7P2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna1iE9Q7P2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms