Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5M4

Zfr2, Zinc finger RNA-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfr2E9Q5M4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zfr2E9Q5M4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zfr2E9Q5M4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Zfr2E9Q5M4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zfr2E9Q5M4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zfr2E9Q5M4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zfr2E9Q5M4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Zfr2E9Q5M4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zfr2E9Q5M4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Zfr2E9Q5M4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Zfr2E9Q5M4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zfr2E9Q5M4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zfr2E9Q5M4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zfr2E9Q5M4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zfr2E9Q5M4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zfr2E9Q5M4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zfr2E9Q5M4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zfr2E9Q5M4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zfr2E9Q5M4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zfr2E9Q5M4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zfr2E9Q5M4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zfr2E9Q5M4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zfr2E9Q5M4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zfr2E9Q5M4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Zfr2E9Q5M4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zfr2E9Q5M4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zfr2E9Q5M4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zfr2E9Q5M4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zfr2E9Q5M4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Zfr2E9Q5M4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Zfr2E9Q5M4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Zfr2E9Q5M4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zfr2E9Q5M4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zfr2E9Q5M4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zfr2E9Q5M4 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zfr2E9Q5M4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zfr2E9Q5M4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zfr2E9Q5M4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zfr2E9Q5M4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zfr2E9Q5M4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zfr2E9Q5M4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zfr2E9Q5M4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zfr2E9Q5M4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zfr2E9Q5M4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zfr2E9Q5M4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zfr2E9Q5M4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zfr2E9Q5M4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zfr2E9Q5M4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zfr2E9Q5M4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zfr2E9Q5M4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Zfr2E9Q5M4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zfr2E9Q5M4 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zfr2E9Q5M4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zfr2E9Q5M4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zfr2E9Q5M4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zfr2E9Q5M4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Zfr2E9Q5M4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zfr2E9Q5M4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zfr2E9Q5M4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zfr2E9Q5M4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zfr2E9Q5M4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zfr2E9Q5M4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zfr2E9Q5M4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zfr2E9Q5M4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zfr2E9Q5M4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zfr2E9Q5M4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zfr2E9Q5M4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zfr2E9Q5M4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zfr2E9Q5M4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zfr2E9Q5M4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Zfr2E9Q5M4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zfr2E9Q5M4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zfr2E9Q5M4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zfr2E9Q5M4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zfr2E9Q5M4 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zfr2E9Q5M4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zfr2E9Q5M4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zfr2E9Q5M4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zfr2E9Q5M4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zfr2E9Q5M4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zfr2E9Q5M4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zfr2E9Q5M4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zfr2E9Q5M4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zfr2E9Q5M4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zfr2E9Q5M4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zfr2E9Q5M4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zfr2E9Q5M4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zfr2E9Q5M4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zfr2E9Q5M4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Zfr2E9Q5M4 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Zfr2E9Q5M4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zfr2E9Q5M4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zfr2E9Q5M4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zfr2E9Q5M4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Zfr2E9Q5M4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zfr2E9Q5M4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zfr2E9Q5M4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Zfr2E9Q5M4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zfr2E9Q5M4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zfr2E9Q5M4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms