Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Trappc8E9PWG2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Trappc8E9PWG2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Trappc8E9PWG2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Trappc8E9PWG2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Trappc8E9PWG2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Trappc8E9PWG2 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Trappc8E9PWG2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Trappc8E9PWG2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Trappc8E9PWG2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Trappc8E9PWG2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Trappc8E9PWG2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Trappc8E9PWG2 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Trappc8E9PWG2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Trappc8E9PWG2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Trappc8E9PWG2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Trappc8E9PWG2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Trappc8E9PWG2 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Trappc8E9PWG2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Trappc8E9PWG2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Trappc8E9PWG2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Trappc8E9PWG2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Trappc8E9PWG2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Trappc8E9PWG2 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Trappc8E9PWG2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Trappc8E9PWG2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Trappc8E9PWG2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Trappc8E9PWG2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Trappc8E9PWG2 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Trappc8E9PWG2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Trappc8E9PWG2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Trappc8E9PWG2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Trappc8E9PWG2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Trappc8E9PWG2 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Trappc8E9PWG2 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Trappc8E9PWG2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Trappc8E9PWG2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Trappc8E9PWG2 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Trappc8E9PWG2 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Trappc8E9PWG2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Trappc8E9PWG2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Trappc8E9PWG2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Trappc8E9PWG2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Trappc8E9PWG2 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Trappc8E9PWG2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Trappc8E9PWG2 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Trappc8E9PWG2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Trappc8E9PWG2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Trappc8E9PWG2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Trappc8E9PWG2 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Trappc8E9PWG2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Trappc8E9PWG2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Trappc8E9PWG2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Trappc8E9PWG2 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Trappc8E9PWG2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Trappc8E9PWG2 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Trappc8E9PWG2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Trappc8E9PWG2 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Trappc8E9PWG2 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Trappc8E9PWG2 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Trappc8E9PWG2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Trappc8E9PWG2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Trappc8E9PWG2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Trappc8E9PWG2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Trappc8E9PWG2 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Trappc8E9PWG2 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Trappc8E9PWG2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Trappc8E9PWG2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Trappc8E9PWG2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Trappc8E9PWG2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Trappc8E9PWG2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Trappc8E9PWG2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Trappc8E9PWG2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Trappc8E9PWG2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Trappc8E9PWG2 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Trappc8E9PWG2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Trappc8E9PWG2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Trappc8E9PWG2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Trappc8E9PWG2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Trappc8E9PWG2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Trappc8E9PWG2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Trappc8E9PWG2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Trappc8E9PWG2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Trappc8E9PWG2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Trappc8E9PWG2 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Trappc8E9PWG2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Trappc8E9PWG2 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Trappc8E9PWG2 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Trappc8E9PWG2 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Trappc8E9PWG2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Trappc8E9PWG2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Trappc8E9PWG2 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Trappc8E9PWG2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Trappc8E9PWG2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Trappc8E9PWG2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Trappc8E9PWG2 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Trappc8E9PWG2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Trappc8E9PWG2 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Trappc8E9PWG2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Trappc8E9PWG2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms